MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4401374396 · doi:10.1016/j.bioana.2024.06.003

An aptamer-based point-of-care diagnostic test strip for rapid diagnosis of surface spike proteins of SARS-CoV2 virus

2024· article· en· W4401374396 sur OpenAlexafffund
Mohamed M. Elsutohy, Steven Raynard, Kirk E. Guyer, Elise Fear, Edward P.L. Roberts, Milana Trifkovic

Notice bibliographique

RevueBiomedical Analysis · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAptamerAnalyteColloidal goldPoint of careGold standard (test)VirusCoronavirusPoint-of-care testingCoronavirus disease 2019 (COVID-19)BiosensorDNASevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyProtein ARNAComputational biologySpike (software development)BiologyChemistryNanotechnologyNanoparticleGeneMolecular biologyMaterials scienceMedicineAntibodyBiochemistryChromatographyComputer scienceGeneticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV2) has been identified as the causative agent for the COVID-19 pandemic. Herein, we report the development of a point-of-care diagnostic (POC) test strip for rapid and specific diagnosis of surface spike protein (S-protein) of SARS-CoV2 virus, as a target analyte for the virus diagnosis. The test detects changes in the physicochemical properties of gold nanoparticles with the utility of a DNA aptamer that is specifically selected for binding to the receptor-binding domain (RBD) of S-protein of SARS-CoV-2. Structural changes in aptamer enables the aggregation/disaggregation of gold nanoparticles in the absence/presence of the target analyte, respectively. Lateral flow assays were utilized to visualize results and stratify positive samples (containing viral S-protein) from negative samples (blank) with high specificity and sensitivity (1–10 nM). The proposed sensing technology was successfully developed for rapid quantification of SARS-CoV2 S-protein; however, it can be further adapted to detect variants, viral DNA/RNA, and other targets, enabling the development of POC devices for multiplexing assays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueBiomedical AnalysisMême sujetSARS-CoV-2 detection and testingTravaux en français237 207