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Enregistrement W4401374396 · doi:10.1016/j.bioana.2024.06.003

An aptamer-based point-of-care diagnostic test strip for rapid diagnosis of surface spike proteins of SARS-CoV2 virus

2024· article· en· W4401374396 sur OpenAlexafffund
Mohamed M. Elsutohy, Steven Raynard, Kirk E. Guyer, Elise Fear, Edward P.L. Roberts, Milana Trifkovic

Notice bibliographique

RevueBiomedical Analysis · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSARS-CoV-2 detection and testing
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAptamerAnalyteColloidal goldPoint of careGold standard (test)VirusCoronavirusPoint-of-care testingCoronavirus disease 2019 (COVID-19)BiosensorDNASevere acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)VirologyProtein ARNAComputational biologySpike (software development)BiologyChemistryNanotechnologyNanoparticleGeneMolecular biologyMaterials scienceMedicineAntibodyBiochemistryChromatographyComputer scienceGeneticsPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV2) has been identified as the causative agent for the COVID-19 pandemic. Herein, we report the development of a point-of-care diagnostic (POC) test strip for rapid and specific diagnosis of surface spike protein (S-protein) of SARS-CoV2 virus, as a target analyte for the virus diagnosis. The test detects changes in the physicochemical properties of gold nanoparticles with the utility of a DNA aptamer that is specifically selected for binding to the receptor-binding domain (RBD) of S-protein of SARS-CoV-2. Structural changes in aptamer enables the aggregation/disaggregation of gold nanoparticles in the absence/presence of the target analyte, respectively. Lateral flow assays were utilized to visualize results and stratify positive samples (containing viral S-protein) from negative samples (blank) with high specificity and sensitivity (1–10 nM). The proposed sensing technology was successfully developed for rapid quantification of SARS-CoV2 S-protein; however, it can be further adapted to detect variants, viral DNA/RNA, and other targets, enabling the development of POC devices for multiplexing assays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,006
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,090
Score d'incertitude au seuil0,755

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,006
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,003
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,296 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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