Evaluating the winter diet of elk using DNA metabarcoding analysis
Notice bibliographique
Résumé
North American elk Cervus canadensis inhabited portions of the eastern United States until extirpation in the mid‐1800s. From 2000 to 2008, 201 elk were reintroduced to the North Cumberland Wildlife Management Area (NCWMA), Tennessee. The stocking source was Elk Island National Park, Alberta Canada where there are two distinct genetic populations isolated from the north and south. This genetic structure has largely persisted in the population after translocation. Food habits were evaluated in the early stages of restoration, but the population has had approximately 20 years to adapt to the landscape, and current food habits are unknown. To assess diet composition using DNA metabarcoding, we collected fecal pellets of elk from 65 openings within the 79 318 ha NCWMA weekly from February to April of 2019. We targeted the ITS2 region of the nuclear ribosomal DNA to amplify vegetation sequences found in the internal portion of the elk feces. DNA metabarcoding of feces was linked to results from an accompanying elk population genetics study to investigate food habits between sexes from the two different genetic groups. The majority (80.298%) of sequences matched plants from 21 genera. The top genera (> 5.000%) represented were Vaccinium (15.216%), Festuca (8.446%), Rosa (6.358%), Robinia (5.793%), and Eleagnus (5.186%). Elk heavily used woody plants before and after spring green‐up (> 50% of diet). However, the quantity of forbs in their diet more than doubled after emergence in the spring. The sex‐genetic groups consumed similar vegetation in approximately proportionate amounts. Diversity analyses revealed a significant difference in plant genera sequence detection between males from the two genetic groups, although this finding is likely explained by limited sample size. NCWMA elk used a variety of forage in the winter and DNA metabarcoding analysis allows for a comprehensive analysis of food habits useful for monitoring how elk respond dietarily to habitat management.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».