MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4401438464 · doi:10.1101/2024.08.05.606708

Ethanol exposure model in zebrafish causes phenotypic, behavioral and gene expression changes that mimic Fetal Alcohol Spectrum Disorders in human birth cohorts

2024· preprint· en· W4401438464 sur OpenAlexaff
Elanur Yılmaz, Nastasia Nelson, Giuseppe Tosto, R. Colin Carter, Çağhan Kızıl

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePrenatal Substance Exposure Effects
Établissements canadiensColumbia College
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésZebrafishPhenotypeBiologyModel organismPrenatal alcohol exposureOffspringGeneticsPhysiologyGenePregnancy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Fetal Alcohol Spectrum Disorders (FASD) represent a significant global health challenge, characterized by physical and neurodevelopmental abnormalities in offspring resulting from prenatal alcohol exposure. This study aims to utilize the zebrafish to examine the phenotypic, behavioral, and molecular changes associated with embryonic ethanol exposure, providing a model for human FASD conditions. Our study exposed zebrafish embryos to 0.5% ethanol during a critical developmental window (2-24 hours post-fertilization) and documented significant craniofacial and cardiac deformities, which recapitulate what has been observed in human FASD in humans. Notably, exposed zebrafish exhibited reduced skull and eye sizes, thickened jaw size, and enlarged heart chambers. We found reduced burst swim distance following a touch stimulus, a novel behavioral assessment of potential deficits in sensory processing such as processing speed and/or stress/startle response, both of which are affected in human FASD. Whole-organism gene expression was found to be altered by ethanol for orthologs of four of five inflammation-related genes for which placental expression was previously found to be altered in response to alcohol in human placentas ( SERPINE1, CRHB, BCL2L1, PSMB4, PTGS2A ). We conclude that the zebrafish model effectively mimics several FASD phenotypes observed in humans, confirming gene expression changes we have previously documented in a human observational study and providing a valuable platform for exploring the underlying mechanisms of alcohol-induced embryonic alterations and for developing diagnostic markers and therapeutic targets for early intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,013

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,233 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)→Même sujetPrenatal Substance Exposure Effects→Travaux en français237 207→