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Enregistrement W4401455203 · doi:10.3390/biom14080977

Elucidating the Subcellular Localization of GLRaV-3 Proteins Encoded by the Unique Gene Block in N. benthamiana Suggests Implications on Plant Host Suppression

2024· article· en· W4401455203 sur OpenAlexafffund
Patrick Lameront, Mehdi Shabanian, Laura M. J. Currie, Catherine Fust, Caihong Li, Alyssa C. Clews, Baozhong Meng

Notice bibliographique

RevueBiomolecules · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaAnalytical Center for the Government of the Russian FederationUniversity of Guelph
Mots-clésNicotiana benthamianaSubcellular localizationGeneHost (biology)Block (permutation group theory)BiologyComputational biologyCell biologyGeneticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Grapevine leafroll-associated virus 3 (GLRaV-3) is a formidable threat to the stability of the global grape and wine industries. It is the primary etiological agent of grapevine leafroll disease (GLD) and significantly impairs vine health, fruit quality, and yield. GLRaV-3 is a member of the genus Ampelovirus, Closteroviridae family. Viral genes within the 3′ proximal unique gene blocks (UGB) remain highly variable and poorly understood. The UGBs of Closteroviridae viruses include diverse open reading frames (ORFs) that have been shown to contribute to viral functions such as the suppression of the host RNA silencing defense response and systemic viral spread. This study investigates the role of GLRaV-3 ORF8, ORF9, and ORF10, which encode the proteins p21, p20A, and p20B, respectively. These genes represent largely unexplored facets of the GLRaV-3 genome. Here, we visualize the subcellular localization of wildtype and mutagenized GLRaV-3 ORFs 8, 9, and 10, transiently expressed in Nicotiana benthamiana. Our results indicate that p21 localizes to the cytosol, p20A associates with microtubules, and p20B is trafficked into the nucleus to carry out the suppression of host RNA silencing. The findings presented herein provide a foundation for future research aimed at the characterization of the functions of these ORFs. In the long run, it would also facilitate the development of innovative strategies to understand GLRaV-3, mitigate its spread, and impacts on grapevines and the global wine industry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,181

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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