Phylogenomics of Phengodidae (Coleoptera: Elateroidea): towards a natural classification of a bioluminescent and paedomorphic beetle lineage, with recognition of a new subfamily
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Phengodidae (Coleoptera: Elateroidea), commonly known as glowworm beetles, are a small family of bioluminescent and paedomorphic beetles. There are few phylogenetic studies of Phengodidae, and these are mostly discordant, especially when comparing morphology-based and molecular-based phylogenetic hypotheses. Here, we used the anchored hybrid enrichment approach to undertake the first phylogenomic analysis of Phengodidae (≤358 loci and 39 taxa) and evaluate the higher-level classification of the group. In agreement with previous molecular studies, we recovered Phengodidae as sister to Rhagophthalmidae, and the Old World Cydistinae as sister to all New World Phengodidae. In contrast to previous hypotheses, both Phengodinae and Mastinocerinae were each recovered as monophyletic. Cenophengus was found to be sister to Mastinocerinae, in contrast to some previous hypotheses that placed it as sister to all New World Phengodidae. Considering its morphological divergence, we here establish Cenophenginae subfam. nov. Despite the largest and most comprehensive sampling of Phengodidae in any molecular-based study to date, we had only limited success in revealing the relationships among genera within the most species-rich subfamily, Mastinocerinae. Further studies should focus on the phylogeny and classification of this taxonomically neglected subfamily, on the phylogenetic placement of enigmatic Penicillophorinae, and on seeking morphological support for the main clades of Phengodidae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».