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Enregistrement W4401497065 · doi:10.5376/tgmb.2024.14.0005

CRISPR/Cas9 in Poplar Lignin Biosynthesis: Advances and Future Prospects

2024· article· en· W4401497065 sur OpenAlexvenueno aff
Yongquan Lu

Notice bibliographique

RevueTree Genetics and Molecular Breeding · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineEngineering
ThématiqueBiofuel production and bioconversion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesState Key Laboratory of Tree Genetics and Breeding, Chinese Academy of Forestry
Mots-clésCRISPRLigninBiosynthesisComputational biologyBiologyBiotechnologyBotanyBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The CRISPR/Cas9 system has emerged as a revolutionary tool for genome editing, offering unprecedented precision and efficiency in modifying genetic material. This systematic review focuses on the application of CRISPR/Cas9 technology in the biosynthesis of lignin in poplar species, highlighting recent advances and future prospects. Lignin, a complex polymer in the cell walls of plants, plays a crucial role in providing structural integrity and resistance to pathogens. However, its recalcitrance poses challenges for industrial processes such as pulping and biofuel production. Recent studies have demonstrated the potential of CRISPR/Cas9 to target and modify genes involved in lignin biosynthesis, thereby reducing lignin content and altering its composition to enhance industrial utility. Several research efforts have successfully employed CRISPR/Cas9 to edit lignin biosynthesis genes in poplar. For instance, the efficient knockout of the phytoene desaturase gene in Populus alba × Populus glandulosa using a single guide RNA (sgRNA) has shown promising results in generating targeted mutations with high efficiency. Similarly, the application of CRISPR/Cas9 in Populus tomentosa Carr. has demonstrated the system's capability to create precise genomic edits, resulting in significant phenotypic changes. Moreover, studies have evaluated the efficiency of various guide RNAs (gRNAs) in poplars, identifying key factors that influence gene editing success, such as GC content and the accessibility of the seed region. The review also discusses the broader implications of CRISPR/Cas9 technology in plant research, including its potential to enhance disease resistance, improve nutritional content, and develop drought-tolerant varieties Despite these advancements, challenges such as off-target effects and the need for efficient delivery methods remain. Future research directions include the development of high-fidelity Cas9 variants and the optimization of delivery systems to minimize off-target modifications and enhance editing efficiency.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,202
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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