Ultrahigh-Throughput Single Emulsion Droplet Screening for the Discovery of New B Antigen Cleaving Enzymes
Notice bibliographique
Résumé
In search of efficient α-galactosidases that can convert B red blood cells (RBCs) to universal type RBCs, we have developed a simple and robust system for ultrahigh-throughput droplet-based microfluidic screening. Here, a multienzyme coupled assay with a fluorogenic B antigen tetrasaccharide substrate is encapsulated within single emulsion water-in-oil droplets alongside single cells from metagenomic libraries. The resulting fluorescent droplets containing candidate B antigen cleaving enzymes are sorted using a commercially available, walk-up droplet sorting instrument before validation, cloning, and characterization of the hits. Using this approach, we identified and characterized an α-1,3-galactosidase ( Pv GH110) from the human gut microbiome capable of converting B-to-O-type RBCs. The simplicity, efficiency, and accessibility of our microfluidic-based system make it suitable for nonspecialist laboratories and offer a promising tool to discover enzymes that enable the generation of a universal O blood type.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».