Absence of Crimean-Congo hemorrhagic fever virus in wild lagomorphs and their ticks in Spanish Mediterranean ecosystems
Notice bibliographique
Résumé
Crimean-Congo hemorrhagic fever virus (CCHFV) is an emerging tick-borne pathogen in different European countries. Since 2013, clinical and fatality cases associated with CCHFV infection have been reported in humans in Spain. During the last few years, endemic circulation of this virus has been detected in ticks and wild ungulates in this country, but the role of other sympatric wild species in the sylvatic cycle of this multi-host virus remains poorly understood. The aims of the present study were to assess exposure to CCHFV in wild lagomorphs in southern Spain, a CCHFV endemic area, and to determine the presence of the virus in ticks feeding on these species. Serum samples from 473 European wild rabbits (Oryctolagus cuniculus) and 162 Iberian hares (Lepus granatensis), and 120 ticks feeding on 85 of these wild lagomorphs were collected on 133 hunting grounds between 2018/2019 and 2021/2022 hunting seasons. The presence of antibodies against CCHFV was assessed in all serum samples using a commercial ELISA, whereas ticks were tested for the presence of CCHFV-RNA by a multiplex RT-qPCR that detects all known genotypes of this virus. None of the 635 (0.0 %; 95 %CI: 0.0-0.6) lagomorphs tested had anti-CCHFV antibodies and CCHFV-RNA was not found in any of the 120 (0.0 %; 95 %CI: 0.0-3.0) ticks analyzed. To the best of the authors knowledge, this is the first epidemiological study conducted on CCHFV in Iberian hare worldwide. Our findings indicate absence of exposure to CCHFV in European wild rabbit and Iberian hare populations, as well as in their ticks, which suggests that they do not seem to play a relevant role in the epidemiology of CCHFV in Mediterranean ecosystems of southern Spain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».