Taxis-enhanced mineralization and co-metabolism of PAHs by bacteria in micrometer-scale environments
Notice bibliographique
Résumé
Polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs) are associated with micropores in sediments and soils. This limits the bioaccessibility of these compounds via existing bioremediation technologies, as biodegradation is strongly influenced by the ability of bacteria to access different sizes of pores. In this work, we employed naphthalene and pyrene as model contaminants to evaluate the transformation capacity of the soil bacterium Pseudomonas putida G7 (2 × 1 μm) via mineralization and co-metabolic activity, respectively. Under non-growing conditions and in the absence of hydraulic flow, we examined how the tactic behavior of this motile bacterium influenced biodegradation of these two PAHs when passing through membranes with micrometer-sized pores (3 and 5 μm). The bacteria were spontaneously retained by the membranes, which blocked the contaminants away from a passive dosing source. However, the cells were mobilized through 5 μm pores after the application plant root exudate components (γ-aminobutyric acid, citrate and fructose) as strong chemoeffectors, which enhanced the mineralization of naphthalene and co-metabolism of pyrene. The tactic-mediated biodegradation enhancement did not occur through 3 μm pores, possibly due a physical constrain to the gradient sensing mechanism. Our results suggest that bacterial transport by chemotaxis may enhance the biotransformation of poorly bioaccessible contaminants present in micro-meter scale environments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».