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Enregistrement W4401542936 · doi:10.1038/s41375-024-02367-8

Loss of Dnajc21 leads to cytopenia and altered nucleotide metabolism in zebrafish

2024· article· en· W4401542936 sur OpenAlexafffund
Sarada Ketharnathan, Sergey V. Prykhozhij, Anna Cordeiro, Kevin Ban, Serkan Doğan, Huy‐Dung Hoang, Mira Liebman, Elaine Leung, Tommy Alain, Irina Alecu, Steffany A. L. Bennett, Miroslava Čuperlović‐Culf, Yigal Dror, Jason N. Berman

Notice bibliographique

RevueLeukemia · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBlood disorders and treatments
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenAgricultural Research Institute of OntarioUniversity of TorontoNational Research Council CanadaAGADA BiosciencesUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCIHR Skin Research Training CentreGovernment of CanadaTerry Fox FoundationLeukemia and Lymphoma Society of CanadaUniversity of OttawaCanadian Institutes of Health ResearchLeukemia and Lymphoma Society
Mots-clésZebrafishBiologyDiamond–Blackfan anemiaGATA1CytopeniaMyeloidGeneticsMutationMutantPhenotypeHaematopoiesisCancer researchCell biologyBone marrowStem cellGeneImmunologyRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in the DNAJC21 gene were recently described in Shwachman-Diamond syndrome (SDS), a bone marrow failure syndrome with high predisposition for myeloid malignancies. To study the underlying biology in hematopoiesis regulation and disease, we generated the first in vivo model of Dnajc21 deficiency using the zebrafish. Zebrafish dnajc21 mutants phenocopy key SDS patient phenotypes such as cytopenia, reduced growth, and defective protein synthesis. We show that cytopenia results from impaired hematopoietic differentiation, accumulation of DNA damage, and reduced cell proliferation. The introduction of a biallelic tp53 mutation in the dnajc21 mutants leads to the development of myelodysplastic neoplasia-like features defined by abnormal erythroid morphology and expansion of hematopoietic progenitors. Using transcriptomic and metabolomic analyses, we uncover a novel role for Dnajc21 in nucleotide metabolism. Exogenous nucleoside supplementation restores neutrophil counts, revealing an association between nucleotide imbalance and neutrophil differentiation, suggesting a novel mechanism in dnajc21-mutant SDS biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,120
Score d'incertitude au seuil0,385

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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