Critical residues in the Ku70 von Willebrand A domain mediate Ku interaction with the LigIV-XRCC4 complex in non-homologous end-joining
Notice bibliographique
Résumé
The Ku heterodimer (Ku70/Ku80) is central to the non-homologous end-joining (NHEJ) pathway. Ku binds to the broken DNA ends and promotes the assembly of the DNA repair complex. The N-terminal Ku70 von Willebrand A (vWA) domain is known to mediate protein-protein interactions important for the repair process. In particular, the D192 and D195 residues within helix 5 of the Ku70 vWA domain were shown to be essential for NHEJ function, although the precise role of these residues was not identified. Here, we set up a miniTurbo screening system to identify Ku70 D192/D195 residue-specific interactors in a conditional, human Ku70-knockout cell line in response to DNA damage. Using fusion protein constructs of Ku70 wild-type and mutant (D192A/D195R) with miniTurbo, we identified a number of candidate proximal interactors in response to DNA damage treatment, including DNA Ligase IV (LigIV), a known and essential NHEJ complex member. Interestingly, LigIV was enriched in our wildtype screen but not the Ku70 D192A/D195R screen, suggesting its interaction is disrupted by the mutation. Validation experiments demonstrated that the DNA damage-induced interaction between Ku70 and LigIV was disrupted by the Ku70 D192A/D195R mutations. Our findings provide greater detail about the interaction surface between the Ku70 vWA domain and LigIV and offer strong evidence that the D192 and D195 residues are important for NHEJ completion through an interaction with LigIV. Altogether, this work reveals novel potential proximal interactors of Ku in response to DNA damage and identifies Ku70 D192/D195 residues as essential for LigIV interaction with Ku during NHEJ.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».