A microRNA396b-growth regulating factor module controls castor seed size by mediating auxin synthesis
Notice bibliographique
Résumé
Castor (Ricinus communis L.) is an importance crop cultivated for its oil and economic value. Seed size is a crucial factor that determines crop yield. Gaining insight into the molecular regulatory processes of seed development is essential for the genetic enhancement and molecular breeding of castor. Here, we successfully fine-mapped a major QTL related to seed size, qSS3, to a 180 kb interval on chromosome 03 using F2 populations (DL01×WH11). A 17.6-kb structural variation (SV) was detected through genomic comparison between DL01 and WH11. Analysis of haplotypes showed that the existence of the complete 17.6 kb structural variant may lead to the small seed characteristic in castor. In addition, we found that qSS3 contains the microRNA396b (miR396b) sequence, which is situated within the 17.6 kb SV. The results of our experiment offer additional evidence that miR396-Growth Regulating Factor 4 (GRF4) controls seed size by impacting the growth and multiplication of seed coat and endosperm cells. Furthermore, we found that RcGRF4 activates the expression of YUCCA6 (YUC6), facilitating the production of IAA in seeds and thereby impacting the growth of castor seeds. Our research has discovered a crucial functional module that controls seed size, offering a fresh understanding of the mechanism underlying seed size regulation in castor.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».