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Enregistrement W4401587195 · doi:10.20944/preprints202408.0509.v1

Post-Translational Modifications of Cysteine Residues in Plant Proteins and Their Impact on the Regulation of Metabolism and Signal Transduction

2024· preprint· en· W4401587195 sur OpenAlexaff
Charlie Boutin, Camille Clément, Jean Rivoal

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRedox biology and oxidative stress
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSignal transductionCysteineChemistryBiochemistryPrenylationMetabolismAmino acidEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Cys is one of the least abundant amino acids in proteins. However, it is often highly conserved and usually found in important structural and functional regions of proteins. Its unique chemical properties allow it to undergo several post-translational modifications, many of which mediated by reactive oxygen, nitrogen, sulfur or carbonyl species. Thus, in addition to their role in catalysis, protein stability and metal binding, Cys residues are crucial for redox regulation of metabolism and signal transduction. In this review, we discuss Cys post-translational modifications (PTMs) and their role in plant metabolism and signal transduction. These modifications include oxidation of the thiol group (S-sulfenylation, S-sulfinylation and S-sulfonylation), the formation of disulfide bridges, S-glutathionylation, persulfidation, S-cyanylation S-nitrosation, S-carbonylation, S-acylation, prenylation, CoAlation as well as the formation of thiohemiacetal. For each of these PTMs, we discuss the origin of the modifier, the mechanisms involved in PTM, as well as their reversibility. Examples of the involvement of Cys ​​PTMs in the modulation of protein structure, function, stability, and localization are presented to highlight their importance in the regulation of plant metabolic and signaling pathways.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,428
Score d'incertitude au seuil0,465

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,264 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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