A leaf-expressed <i>TERMINAL FLOWER1</i> ortholog from coffee with alternate splice forms alters flowering time and inflorescence branching in <i>Arabidopsis</i>
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Perennial, polycarpic species, such as Coffea sp L. (coffee), exhibit asynchronous flowering while maintaining concomitant vegetative growth. This growth dichotomy is associated directly with fruit development and maturation time. To identify molecular components that underlie asynchronous flowering, we isolated phosphatidylethanolamine binding protein (PEBP) homologs expressed in coffee and identified a gene with high similarity to Arabidopsis TERMINAL FLOWER1-like . In Arabidopsis, interaction of TFL1 (AtTFL1) with bZIP transcription factor floral regulator FD (AtFD) forms a floral repressor complex that maintains inflorescence meristems in an indeterminate state. Unlike AtTFL1 , which is expressed only in the shoot apical meristem, CaTFL1 transcript was detected exclusively in coffee leaves. Moreover, this transcript retained an intron, which was not reported for AtTFL1 . CaTFL1 was characterized through heterologous expression in Arabidopsis and protein interaction analysis. Ectopic overexpression of CaTFL1 in transgenic Arabidopsis plants caused extreme late flowering or prevented flowering. However, the most severe floral repressive activity occurred in transgenic plants that spliced out the extra intron from CaTFL1 . Yeast two hybrid assay revealed that CaTFL1 protein encoded by the spliced mRNA interacts with AtFD, as well as Arabidopsis 14-3-3 protein. These findings suggest that CaTFL1 acts as a leaf-expressed floral repressor, whose activity is controlled by alternate splicing, and may contribute to asynchronous flowering in coffee.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».