The end of the road for blood RNA biomarkers as triage tests for symptomatic pulmonary tuberculosis among spontaneous sputum producers?
Notice bibliographique
Résumé
Extract In 2022, an estimated 3.1 million people with tuberculosis (TB) remained undiagnosed [1] despite the global roll-out of rapid molecular tests for Mycobacterium tuberculosis, such as Xpert Ultra and Truenat MTB plus [2]. In pulmonary TB, these tests rely on the availability of a respiratory sample. Sputum induction or invasive sampling are required in sputum-scarce individuals, but often unavailable in resource-limited settings. Moreover, even among spontaneous sputum producers, resource constraints may limit the number of rapid molecular tests for M. tuberculosis that can be performed programmatically. Detecting host immune perturbations in response to M. tuberculosis infection, for example with blood RNA biomarkers, has been proposed as a triage approach to guide further confirmatory testing. Such an approach seeks to reduce the number of confirmatory tests performed, and direct these tests to higher risk individuals. Numerous RNA signatures, comprising quantitation of the expression of one or more genes, have been described with excellent diagnostic performance in their discovery populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,023 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,002 |
| Communication savante | 0,002 | 0,005 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,024 | 0,021 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,008 | 0,009 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».