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Enregistrement W4401625811 · doi:10.1101/2024.08.14.24311888

Generating Advancements in Longitudinal Analysis in X and Y Variations: Rationale, Design, and Methods for the GALAXY Registry

2024· preprint· en· W4401625811 sur OpenAlexaff
Alexandra Carl, Samantha Bothwell, Karli Swenson, Ryan Bregante, Lilian Cohen, Virginia Cover, Anna Dawczyk, Gail Decker, Stephen B. Gerken, David S. Hong, Susan Howell, Armin Raznahan, Alan D. Rogol, Nicole Tartaglia, Shanlee Davis

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePrenatal Screening and Diagnostics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSocioeconomic statusDiversity (politics)Race (biology)GeocodingEthnic groupDemographyMedicinePsychologyGeographyCartographyPopulationSociologyGender studies

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Sex chromosome aneuploidies (SCAs) are a family of genetic disorders that result from an atypical number of X and/or Y chromosomes. SCAs are the most common chromosomal abnormality, affecting ∼1/400 live births, yet are often underdiagnosed, leading to over-representation of more severely impacted individuals in many clinical studies. In addition to this ascertainment bias, existing work in SCAs has also been limited by low geographic and demographic diversity. To address these limitations, we have created the Generating Advancements with Longitudinal Analysis in X and Y variations (GALAXY) Registry. To date, GALAXY has accrued 295 verified SCA participants. Next steps include targeted recruitment of minoritized individuals regarding race, ethnicity, and socioeconomic status, and continuing engagement with the SCA community.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,280
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,314
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Protocole · Signal consensuel: Protocole
Score de désaccord entre enseignants0,280
Score d'incertitude au seuil0,887

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2800,314
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0040,004
Communication savante0,0040,002
Science ouverte0,0050,008
Intégrité de la recherche0,0030,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,065
Tête enseignante GPT0,389
Écart entre enseignants0,324 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreProtocole

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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