MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4401689253 · doi:10.1002/jmd2.12442

Reduced guanidinoacetate in plasma of patients with autosomal dominant Fanconi syndrome due to heterozygous <scp>P341L <i>GATM</i></scp> variant and study of organoids towards treatment

2024· article· en· W4401689253 sur OpenAlexaff
Ignacio Portales Castillo, R. Singal, Anastasia Ambrose, Jong Hee Song, Minsoo Son, Young Ah Goo, Wen Zhou, Avram Z. Traum, Ariella Coler‐Reilly, Benjamin D. Humphreys, Roberto Civitelli, Harald Jüppner, Andrew L. Lundquist, Peter Seres, Andrew S. Allegretti, Saadet Mercimek‐Andrews

Notice bibliographique

RevueJIMD Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMetabolism and Genetic Disorders
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésOrganoidGeneticsMedicineMolecular biologyBiologyChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Autosomal dominant Fanconi syndrome due to a GATM variant (GATM‐FS), causes accumulation of misfolded arginine‐glycine amidinotransferase (AGAT) in proximal renal tubules leading to cellular injury. GATM‐FS presents during childhood and progresses to end‐stage kidney disease (ESKD) in adults. We study creatine metabolism in two individuals of unrelated families with a known GATM variant and the effect of creatine supplementation in kidney organoids. Plasma and urine metabolites were measured by mass spectrometry. Brain creatine was assessed by magnetic resonance spectroscopy (MRS). Guanidinoacetate (GAA) synthesis by the AGAT mutant was measured in patient‐derived immortalized lymphocytes using stable isotopes of arginine and glycine. The effect of creatine on GATM expression was assessed in human kidney cells and organoids. Several family members from two unrelated families were diagnosed with Fanconi syndrome and had the c.1022C&gt;T (p. P341L) variant in GATM . Two affected individuals in both families had moderately reduced plasma GAA levels. In comparison to wild‐type cells, GAA synthesis by patient‐derived GATM P341L+/− lymphoblastoid cell lines (LCL) was reduced, but not absent as in GATM cells from a patient with creatine deficiency syndrome. In vitro studies on human kidney organoids revealed reduced AGAT expression after treatment with creatine. Finally, we showed in one patient that creatine supplementation (5 g daily) substantially increased plasma creatine levels. We report low plasma and urine GAA in patients with autosomal dominant GATM‐FS and show that creatine downregulates AGAT in human kidney cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,321
Score d'incertitude au seuil0,735

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,219
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJIMD ReportsMême sujetMetabolism and Genetic DisordersTravaux en français237 207