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Enregistrement W4401690570 · doi:10.4049/jimmunol.2400114

The Evolving Portrait of γδ TCR Recognition Determinants

2024· review· en· W4401690570 sur OpenAlexaff
Chhon Ling Sok, Jamie Rossjohn, Benjamin S. Gully

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytokine Signaling Pathways and Interactions
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Health and Medical Research CouncilAustralian Research CouncilNational Institutes of HealthDepartment of Education and TrainingDepartment of Health and Aged Care, Australian Government
Mots-clésPortraitT-cell receptorComputer scienceArtBiologyArt historyGeneticsT cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In αβ T cells, immunosurveillance is enabled by the αβ TCR, which corecognizes peptide, lipid, or small-molecule Ags presented by MHC- and MHC class I-like Ag-presenting molecules, respectively. Although αβ TCRs vary in their Ag recognition modes, in general they corecognize the presented Ag and the Ag-presenting molecule and do so in an invariable "end-to-end" manner. Quite distinctly, γδ T cells, by way of their γδ TCR, can recognize ligands that extend beyond the confines of MHC- and MHC class I-like restrictions. From structural studies, it is now becoming apparent that γδ TCR recognition modes can break the corecognition paradigm and deviate markedly from the end-to-end docking mechanisms of αβ TCR counterparts. This brief review highlights the emerging portrait of how γδ TCRs can recognize diverse epitopes of their Ags in a manner reminiscent to how Abs recognize Ags.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,002
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,366
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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