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Enregistrement W4401690600 · doi:10.1101/2024.08.19.608538

Metabolization of microbial postbiotic pentanoate drives anti-cancer CAR T cells

2024· preprint· en· W4401690600 sur OpenAlexaff
Sarah Staudt, Fabian Nikolka, Markus Perl, Julia Franz, Noémie Leblay, Xiaoli-Kat Yuan, Linda Warmuth, Teng Fei, Maria Bromberg, Patxi San Martín‐Úriz, Juan Roberto Rodriguez-Madoz, Kai Ziegler-Martin, Pascal Benz, Fabian Freitag, Zeno Riester, Christoph K. Stein‐Thoeringer, Michael Schmitt, Karin Kleigrewe, Justus Weber, Kira Mangold, Hermann Einsele, Felipe Prósper, Wilfried Ellmeier, Dirk H. Busch, Alexander Visekruna, John Slingerland, Roni Shouval, Karsten Hiller, Patrick Pausch, Paola Neri, Marcel R.M. van den Brink, Hendrik Poeck, Michael Hudecek, Maik Luu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCAR-T cell therapy research
Établissements canadiensAlberta Cancer FoundationUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesInstituto de Salud Carlos IIIEuropean Regional Development FundHorizon 2020 Framework ProgrammeNational Cancer InstituteNational Institutes of HealthMinisterio de Ciencia e InnovaciónMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterLietuvos Mokslo TarybaAustrian Science FundCentro de Investigación Biomédica en Red de CáncerEuropean Commission
Mots-clésCrosstalkEpigeneticsMetaboliteImmunityBiologyChemistryCancer researchComputational biologyCell biologyGeneticsImmune systemGeneBiochemistryEngineeringElectronic engineering

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The microbiome is a complex host factor and key determinant of the outcome of antibody-based and cellular immunotherapy. Its postbiotics are a blend of soluble commensal byproducts that are released into the host environment and have been associated with the regulation of immune homeostasis, particularly through impacts on epigenetics and cell signaling. In this study, we show that the postbiotic pentanoate is metabolized to citrate within the TCA cycle via both the acetyl- and succinyl-CoA entry points, a feature uniquely enabled by the chemical structure of the C5 aliphatic chain. We identified ATP-citrate lyase as the crucial factor that redirects pentanoate-derived citrate from the succinyl-CoA route to the nucleus, thereby linking metabolic output and histone acetylation. This epigenetic-metabolic crosstalk mitigated T cell exhaustion and promoted naive-like differentiation in pentanoate-programmed chimeric antigen receptor (CAR) T cells. The predictive and therapeutic potential of pentanoate was corroborated in two independent patient cohorts and three syngeneic models of CAR T adoptive therapy. Our data demonstrate that postbiotics are integrated into mitochondrial metabolism and subsequently incorporated as epigenetic imprints. This bridge between microbial and mammalian interspecies communication can ultimately impact T cell differentiation and efficacy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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