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Enregistrement W4401717959 · doi:10.7554/elife.100248.1.sa1

Reviewer #2 (Public Review): SARS-CoV-2 NSP13 interacts with TEAD to suppress Hippo-YAP signaling

2024· peer-review· en· W4401717959 sur OpenAlexfundno aff

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepeer-review
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHippo pathway signaling and YAP/TAZ
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesVivian L. Smith FoundationNational Institutes of HealthTexas Heart InstituteMcGill UniversityAmerican Heart Association
Mots-clésHippo signaling pathwayCoronavirus disease 2019 (COVID-19)Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2)Cell biologyGeneticsBiologySignal transductionMedicineInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Hippo pathway is critical to organ development, homeostasis, and regeneration, facilitated by YAP/TEAD-mediated gene expression. Although emerging studies report Hippo-YAP dysfunction after viral infection, it is largely unknown in the context of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). Here, we analyzed RNA sequencing data from SARS-CoV-2 infected human lung samples and induced pluripotent stem cell–derived cardiomyocytes (iPSC-CMs), and observed a decrease in YAP target gene expression. In screening SARS-CoV-2 nonstructural proteins, we found that nonstructural protein 13 (NSP13), a conserved coronavirus helicase, inhibited YAP transcriptional activity independent of the upstream Hippo kinases LATS1/2. Consistently, introducing NSP13 into cardiomyocytes suppressed active YAP (YAP5SA) in vivo. Subsequent investigations on NSP13 mutants indicated that NSP13 helicase activity is crucial for suppressing YAP transactivation. Mechanistically, TEAD4 serves as a platform for recruiting NSP13 and YAP. NSP13 inactivates the YAP/TEAD4 transcription complex through its interacting proteins, such as transcription termination factor 2 (TTF2). These discoveries reveal a novel YAP/TEAD regulatory mechanism orchestrated by TEAD4, which provides molecular insights of Hippo-YAP regulation after SARS-CoV-2 infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,023
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,112
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Évaluation · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,977
Score d'incertitude au seuil0,317

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0230,112
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,004
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0030,002
Communication savante0,0090,005
Science ouverte0,0060,003
Intégrité de la recherche0,0200,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0950,047

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,044
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
DomaineÉvaluation
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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