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Enregistrement W4401729323 · doi:10.1002/cyto.b.22202

Flow cytometry assay modifications: Recommendations for method validation based on <scp>CLSI H62</scp> guidelines

2024· review· en· W4401729323 sur OpenAlexaff
Sara A. Monaghan, Steven Eck, Silvia T. Bunting, Xiangyang X. Dong, Robert J. Durso, Christèle Gonneau, Amanda Hays, Andrea Illingworth, Stacy C. League, Eleni Linskens, Megan McCausland, Thomas W. McCloskey, Nina Rolf, Min Shi, Paul K. Wallace, Virginia Litwin, Wolfgang Kern, George Deeb, Veronica Nash, Horatiu Olteanu

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2024
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics
Établissements canadiensBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStandardizationWorkflowComputer scienceMedical physicsGuidelineMedicineData sciencePathologyDatabase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) H62-Validation of Assays Performed by Flow Cytometry guideline, released in 2021, provides recommendations for platform workflow and quality system essentials, instrument setup and standardization, assay development and optimization and fit-for-purpose analytical method validation. In addition, CLSI H62 includes some recommendations for the validation strategies after a validated flow cytometric method has been modified. This manuscript builds on those recommendations and discusses the impact of different types of assay modifications on assay performance. Recommendations regarding which validation parameters to evaluate depending on the type of modification are provided. The impact of assay modification on the assay's intended use is discussed. When recommending minor deviations from the CLSI H62 process for a laboratory-initiated assay revision (e.g., specimen numbers for sensitivity, specificity, or precision studies), a rationale based on expert opinion is provided with the understanding that not every laboratory, assay type, and circumstance can be comprehensively addressed in this paper. These recommendations are meant as a practical recommendation and are not intended to be restrictive, prescriptive, or understood as necessarily sufficient to meet every specific requirement from regulatory bodies (e.g., FDA or New York State Department of Health).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,038
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,045
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil0,202

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0380,045
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,003
Bibliométrie0,0090,005
Études des sciences et des technologies0,0010,003
Communication savante0,0050,004
Science ouverte0,0070,003
Intégrité de la recherche0,0070,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0140,027

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,300
Tête enseignante GPT0,501
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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