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Enregistrement W4401731954 · doi:10.1101/2024.08.22.609092

Activation and Evasion of the FEAR Pathway by RNA Viruses

2024· preprint· en· W4401731954 sur OpenAlexaff
Emily A. Rex, Dahee Seo, Aaron Embry, Rozanne Arulanandam, Marcus M. Spinelli, Jean‐Simon Diallo, Don B. Gammon

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueVirus-based gene therapy research
Établissements canadiensOttawa HospitalUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEvasion (ethics)RNAVirologyBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

). The human FEAR pathway is mediated by the FACT complex, consisting of hSpt16 and SSRP1 subunits, that remodels chromatin to activate expression of the antiviral transcription factor, ETS-1. To counter this pathway, poxvirus A51R proteins tether SUMOylated hSpt16 subunits to microtubules to prevent ETS-1 expression. While these observations indicate a role for the FEAR pathway in DNA virus restriction, it was unclear if RNA viruses interact with this pathway. Here, we show that RNA viruses are also restricted by the FEAR pathway, yet encode mechanisms distinct from poxviruses to counter this response. We show vesicular stomatitis virus (VSV), a rhabdovirus, utilizes its matrix (M) protein to promote proteasome-dependent degradation of SUMOylated hSpt16 and to block ETS-1 nuclear import. Strains encoding mutant M proteins that cannot antagonize the FEAR pathway exhibit replication defects in human cells that can be rescued by hSpt16 or ETS-1 depletion. Moreover, FACT inhibitor treatment enhanced the replication of oncolytic VSV strains encoding defective M proteins in restrictive cancer cells, suggesting FEAR pathway inhibition may improve oncolytic virotherapy. Strikingly, we provide evidence that the inability of VSV M to degrade SUMOylated Spt16 in lepidopteran insect cells results in abortive infection, suggesting VSV-Spt16 interactions influence virus host range. Lastly, we show that human and murine paramyxovirus target SUMOylated Spt16 proteins for degradation in human and murine cells utilizing a conserved N-terminal motif in their accessory "C" proteins. Collectively, our study illustrates that DNA and RNA viruses have independently evolved diverse mechanisms to antagonize SUMOylated host Spt16 proteins, underscoring the physiological importance of the FEAR pathway to antiviral immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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