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Enregistrement W4401735396 · doi:10.14785/lymphosign-2024-0006

Novel variant in <i>IGHM</i> gene in a patient with agammaglobulinemia: A case report of a preschool child presenting with recurrent pneumonia

2024· article· en· W4401735396 sur OpenAlexaffvenue
Erin Joy Heifetz, Anahita Dehmoobad Sharifabadi, Rae Brager, Jenny Garkaby

Notice bibliographique

RevueLymphoSign Journal · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésX-linked agammaglobulinemiaPrimary immunodeficiencyImmunodeficiencyPneumoniaContext (archaeology)ImmunologyCommon variable immunodeficiencyMedicineAntibodyBiologyPediatricsImmune systemBruton's tyrosine kinaseInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: Agammaglobulinemia is a primary immunodeficiency characterized by absent B cells and originates from X-linked or autosomal mutations affecting B cell maturation. While the most common agammaglobulinemia is X-linked, one well-documented site of autosomal recessive agammaglobulinemia is within the immunoglobulin μ heavy chain protein, encoded by the IGHM gene. Such variants frequently result in clinical presentations of recurrent bacterial infections early in life. Aim: To describe a case of a five-year-old female with agammaglobulinemia resulting from a novel homozygous IGHM variant, presenting with pneumonia complicated by empyema and H. influenzae bacteremia. Methods: Case data was compiled retrospectively from the patient’s medical chart, including relevant laboratory testing for immunoglobulins, quantitative B cell subsets, and genetic testing using a primary immunodeficiency panel. Results: The proband is a 5-year-old female with a history of recurrent pneumonia, presenting with H. influenzae bacteremia in the context of pneumonia complicated by an empyema. Investigations revealed low immunoglobulin levels, absent vaccine responses, and undetectable B cells on flow cytometry. Genetic testing revealed a novel homozygous variant in the IGHM gene: c.775T>C, p.Trp259Arg. Conclusion: Autosomal recessive agammaglobulinemia is a rare but severe, treatable disorder of the immune system which typically presents in early childhood. Hypomorphic mutations, while less commonly reported in the literature, are an important consideration in atypical presentations of primary immunodeficiencies, such as in the case presented. Statement of Novelty: Herein, we report a case of agammaglobulinemia presenting with a novel homozygous variant in the IGHM gene leading to later onset agammaglobulinemia in a 5-year-old female.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0040,003
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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