Random Forest and K-Means Clustering Algorithms to Classify of <sup>18</sup>F-Florbetapir Brain PET
Notice bibliographique
Résumé
This paper explores and compares the use of two common machine learning (ML) algorithms, random forests (RF) and k-means clustering (KMC), for classifying18F-florbetapir brain PET as positive or negative for amyloid deposition. The pilot dataset consists of 6518F-Florbetapir PET and corresponding MRI studies taken from the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI), in patients with mild cognitive impairment (MCI). Each PET scan was read as positive or negative for amyloid deposition by two physicians dual board certified in nuclear medicine and radiology with final interpretation based on consensus. This clinical interpretation of the PET scans served as the gold standard. Using an image processing pipeline, standardized uptake value ratios (SUVR) were computed in 57 brain regions, with normalization to the cerebellar gray matter. The RF algorithm had a slightly higher classification accuracy (91±6%) compared with the KMC algorithm (81±3%), using 4-fold cross-validation. However, the KMC algorithm had lower computational cost and may highlight equivocal cases on clinical interpretation. Further investigation is ongoing.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,007 | 0,014 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,006 | 0,004 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,004 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».