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Enregistrement W4401752800 · doi:10.1109/ismvl60454.2024.00040

Random Forest and K-Means Clustering Algorithms to Classify of <sup>18</sup>F-Florbetapir Brain PET

2024· article· en· W4401752800 sur OpenAlexafffund
Alexa Bootherstone, Louis Lee, Liam Cristant, Phillip H. Kuo, Carlos Uribe, Sandra E. Black, Katherine Zukotynski, Vincent Gaudet

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMedical Imaging Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of WaterlooSunnybrook Health Science CentreUniversity of British ColumbiaMcMaster UniversityQueen's UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRandom forestCluster analysisComputer scienceAlgorithmArtificial intelligence

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This paper explores and compares the use of two common machine learning (ML) algorithms, random forests (RF) and k-means clustering (KMC), for classifying18F-florbetapir brain PET as positive or negative for amyloid deposition. The pilot dataset consists of 6518F-Florbetapir PET and corresponding MRI studies taken from the Alzheimer's Disease Neuroimaging Initiative (ADNI), in patients with mild cognitive impairment (MCI). Each PET scan was read as positive or negative for amyloid deposition by two physicians dual board certified in nuclear medicine and radiology with final interpretation based on consensus. This clinical interpretation of the PET scans served as the gold standard. Using an image processing pipeline, standardized uptake value ratios (SUVR) were computed in 57 brain regions, with normalization to the cerebellar gray matter. The RF algorithm had a slightly higher classification accuracy (91±6%) compared with the KMC algorithm (81±3%), using 4-fold cross-validation. However, the KMC algorithm had lower computational cost and may highlight equivocal cases on clinical interpretation. Further investigation is ongoing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,003
Bibliométrie0,0060,004
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,004

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,332
Écart entre enseignants0,304 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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