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Enregistrement W4401757666 · doi:10.3390/ani14162442

CMAH Coding Sequence Variants in 15 Non-Domestic Felid Species Related to ABC Blood Group System

2024· article· en· W4401757666 sur OpenAlexaboutno aff
Alexandra Kehl, Henrike Kuder, Lily Parkinson, Amie Koenig, Ines Langbein‐Detsch, Elisabeth Mueller, Urs Giger

Notice bibliographique

RevueAnimals · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBlood groups and transfusion
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGeneticsBiologyCoding regionComputational biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Different blood group systems have been characterized in people and other mammals. In domestic cats, the ABC blood group system plays the most important clinical role and has been investigated extensively—from the phenotype to the molecular genetics. In non-domestic felids, phenotypic ABC blood typing has been performed by different methods to detect the antigens, but the four informative CMAH markers in domestic cats were not able to identify types B and C (AB) in non-domestic cats. In this study, 138 blood samples from 15 non-domestic (wild) felid species were investigated by CMAH exonic sequencing and genotyping for putative variants causing type B or C (AB) and correlation to the respective ABC blood phenotype. A total of 58 CMAH variants were found, including 15 missense and 43 synonymous CMAH variants. One variant (c.635G>C) was concordant with blood type B (and C) in cheetahs and type B in cougars, compared to blood type A in all other felid species (lion, tiger, Canada lynx, snow leopard, clouded leopard, serval, jaguar, fishing cat, Pallas cat, bobcat, black footed cat, leopard, and sand cat). Since cheetahs and cougars belong to the genera puma, it could not be determined if the common CMAH variant is either a marker for type B (or C) or is just common in pumas.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,913
Score d'incertitude au seuil0,638

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,261 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
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