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Enregistrement W4401779089 · doi:10.1158/2767-9764.crc-24-0292

The Proteogenomics of Prostate Cancer Radioresistance

2024· article· en· W4401779089 sur OpenAlexafffund
Roni Haas, Gavin Frame, Shahbaz Khan, Beth K. Neilsen, Boon Hao Hong, Celestia P.X. Yeo, Takafumi N. Yamaguchi, Enya H.W. Ong, Wenyan Zhao, Benjamin Carlin, Eugenia L.L. Yeo, Kah Min Tan, Yuan Zhe Bugh, Chenghao Zhu, Rupert Hugh-White, Julie Livingstone, Dennis J.J. Poon, Pek Lim Chu, Yash Patel, Shu Tao, Vladimir Ignatchenko, Natalie J. Kurganovs, Geoff S. Higgins, Michelle R. Downes, Andrew Loblaw, Danny Vesprini, Amar U. Kishan, Melvin L.K. Chua, Thomas Kislinger, Paul C. Boutros, Stanley K. Liu

Notice bibliographique

RevueCancer Research Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensPrincess Margaret Cancer CentreUniversity Health NetworkHealth Sciences CentreUniversity of TorontoSunnybrook Health Science Centre
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineInstituto Tecnológico de Costa RicaNational Cancer InstituteNational Medical Research CouncilUniversity of TorontoProstate Cancer CanadaMedical Research CouncilDuke-NUS Medical SchoolProstate Cancer FoundationMovember FoundationNational Institutes of HealthCancer Research UKSunnybrook FoundationU.S. Department of Defense
Mots-clésProteogenomicsRadioresistanceProstate cancerProstateCancerMedicineOncologyCancer researchInternal medicineBiologyRadiation therapy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prostate cancer is frequently treated with radiotherapy. Unfortunately, aggressive radioresistant relapses can arise, and the molecular underpinnings of radioresistance are unknown. Modern clinical radiotherapy is evolving to deliver higher doses of radiation in fewer fractions (hypofractionation). We therefore analyzed genomic, transcriptomic, and proteomic data to characterize prostate cancer radioresistance in cells treated with both conventionally fractionated and hypofractionated radiotherapy. Independent of fractionation schedule, resistance to radiotherapy involved massive genomic instability and abrogation of DNA mismatch repair. Specific prostate cancer driver genes were modulated at the RNA and protein levels, with distinct protein subcellular responses to radiotherapy. Conventional fractionation led to a far more aggressive biomolecular response than hypofractionation. Testing preclinical candidates identified in cell lines, we revealed POLQ (DNA Polymerase Theta) as a radiosensitizer. POLQ-modulated radioresistance in model systems and was predictive of it in large patient cohorts. The molecular response to radiation is highly multimodal and sheds light on prostate cancer lethality. SIGNIFICANCE: Radiation is standard of care in prostate cancer. Yet, we have little understanding of its failure. We demonstrate a new paradigm that radioresistance is fractionation specific and identified POLQ as a radioresistance modulator.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,885
Score d'incertitude au seuil0,386

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,140
Tête enseignante GPT0,476
Écart entre enseignants0,337 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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