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Enregistrement W4401781797 · doi:10.20944/preprints202110.0295.v5

Multi-Host Pathogen Transmission and the Disease-Diversity Relationship

2024· preprint· en· W4401781797 sur OpenAlexaff
Marjolein E.M. Toorians, Ailene MacPherson, T. Jonathan Davies

Notice bibliographique

RevuePreprints.org · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHost (biology)BiologyTransmission (telecommunications)CoevolutionWildlifeWildlife diseaseBiodiversityEcologyPathogenEvolutionary biologySpillover effectDisease transmissionGeneticsVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Disease transmission in wildlife is linked to ecosystem and human health, and host community structure can mediate pathogen spread. Here, we decompose the well-known susceptible-infected (SI) compartmental models of disease transmission for multi-host communities to explore the disease-biodiversity relationship. We examine the parameters involved in interspecific transmission and link them to the multi-host outbreak potential, R0. We partition R0 into its separate elements that can be associated with either the recipient or donating host, and show how this allows us to identify maintenance versus spillover hosts, allowing us to quantify separate stages of spillover into a novel, recipient host. We further suggest that the evolutionary relatedness between donating and recipient host may play a role in the probability a pathogen establishes in a novel species, as illustrated by the observed phylogenetic signal in the host-breadth of multi-host pathogens. We discuss how anthropogenic changes to the environment and wildlife communities, such as the reduction and fragmentation of wildlife habitat, might alter the mode and dynamics of disease transmission. This discussion contributes to the ongoing debate on the relationship between disease incidence and biodiversity. Through a synthesis of classic ecological theory, we illustrate how pathogens can affect host populations through phenomena such as in/direct symbioses, that can save a pathogen from extinction or suppress competing host species, but we highlight how host diversity can simultaneosuly influence the survival and success of the pathogen, suggesting a complex feedback between hosts and parasites in multi-host communities. Our review provides a guide to common derivations of interspecific transmission, and underscores the critical connections between community and disease-ecology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,003
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,068
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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