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Enregistrement W4401797296 · doi:10.1093/jrsssb/qkae084

A nonparametric framework for treatment effect modifier discovery in high dimensions

2024· article· en· W4401797296 sur OpenAlexfundno aff
Philippe Boileau, Ning Leng, Nima S. Hejazi, Mark van der Laan, Sandrine Dudoit

Notice bibliographique

RevueJournal of the Royal Statistical Society Series B (Statistical Methodology) · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueStatistical Methods in Clinical Trials
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésNonparametric statisticsDrug discoveryComputational biologyComputer sciencePsychologyEconometricsMathematicsBiologyBioinformatics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Heterogeneous treatment effects are driven by treatment effect modifiers (TEMs), pretreatment covariates that modify the effect of a treatment on an outcome. Current approaches for uncovering these variables are limited to low-dimensional data, data with weakly correlated covariates, or data generated according to parametric processes. We resolve these issues by proposing a framework for defining model-agnostic TEM variable importance parameters (TEM-VIPs), deriving one-step, estimating equation, and targeted maximum likelihood estimators of these parameters, and establishing these estimators’ asymptotic properties. This framework is showcased by defining TEM-VIPs for data-generating processes with continuous, binary, and time-to-event outcomes with binary treatments, and deriving accompanying asymptotically linear estimators. Simulation experiments demonstrate that these estimators’ asymptotic guarantees are approximately achieved in realistic sample sizes in randomized and observational studies alike. This methodology is also applied to gene expression data collected in a clinical trial assessing the effect of a novel therapy on disease-free survival in breast cancer patients. Predicted TEMs have previously been linked to treatment resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,328
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,364
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,328
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0030,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,362
Tête enseignante GPT0,529
Écart entre enseignants0,167 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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