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Enregistrement W4401803628 · doi:10.1016/j.jafr.2024.101362

Identification of novel functional compounds from forest onion and its biological activities against breast cancer

2024· article· en· W4401803628 sur OpenAlexaff
Fahrul Nurkolis, Isma Kurniatanty, Elvan Wiyarta, Happy Kurnia Permatasari, Nelly Mayulu, Nurpudji Astuti Taslim, Raymond R. Tjandrawinata, Hardinsyah Hardinsyah, Trina Ekawati Tallei, Apollinaire Tsopmo, Son Radu, Edwin Hadinata, Bonglee Kim, Rosy Iara Maciel de Azambuja Ribeiro, Rony Abdi Syahputra

Notice bibliographique

RevueJournal of Agriculture and Food Research · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueGarlic and Onion Studies
Établissements canadiensCarleton University
Organismes subventionnairesUniversitas Sumatera Utara
Mots-clésIdentification (biology)Breast cancerComputational biologyCancerBiologyTraditional medicineMedicineBotanyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The discovery of new molecules from natural sources for the treatment of tumors such as breast cancers is of importance for the development of functional foods and to the pharmaceutical industry. A natural resource with potential activity against breast cancer is forest onion, Eleutherine bulbosa (Mill.) Urb., but the identity of its active constituents and their mechanisms of action remain unexplored. Therefore, this study focuses on metabolite profiling, in silico or pharmacoinformatic activity and mechanisms, as well as advanced validation on in vitro cell lines. Ten compounds identified in E. bulbosa bulb ethanolic extract (EBE) showed cancer receptor and radical inhibitory activity via network pharmacology and molecular docking simulation. The most promising compound was avenasterol binding PARP-1, HER2, iNOS receptors with values of −11.26, −8.34, and −9.17 μg/mL, respectively. EBE and avenasterol had a smaller EC50 value, or higher potency, than the control antioxidant Trolox in radical scavenging tests with ABTS and DPPH. In line with the in silico study, EBE and avenasterol showed antiproliferative activity against human breast cancer MCF-7 with LD50 217.8 μg/mL, with relatively low cytotoxicity to normal MCF-10A cells (LD50 > 1000 μg/mL). The antiproliferative mechanism of EBE on MCF-7 was associated with downregulation of TGF-β, HER2, PI3K, and AKT which are known tumor activators. Significant (p < 0.05) upregulation of tumor suppressor gene miR-29a-3p in MCF-7 was observed after treatment with EBE in a dose-dependent manner.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,977
Score d'incertitude au seuil0,150

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,108
Tête enseignante GPT0,317
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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