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Enregistrement W4401805342 · doi:10.1101/2024.08.23.609319

Inferring plant community phenology via bee-collected pollen

2024· preprint· en· W4401805342 sur OpenAlexaff
Sydney B. Wizenberg, Mateus Pepinelli, Bao Ngoc, Mashaba Moubony, Darya Tamashekan, Ida M. Conflitti, Amro Zayed

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhenologyPollenGeographyEcologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

ABSTRACT Global climate change is producing novel biospheric conditions, presenting a threat to the stability of ecological systems and the health of the organisms that reside within them. Variation in climatic conditions is expected to facilitate phenological reshuffling within plant communities, impacting the plant-pollinator interface, and the release of allergenic pollen into the atmosphere. Impacts on plant, invertebrate, and human health remain unclear largely due to the variable nature of phenological reshuffling and insufficient monitoring of these trends. Large-scale temporal surveillance of plant community flowering has been difficult in the past due to logistical constraints. To address this, we set out to test if metabarcoding of honey bee collected pollen could be used to infer the phenology of plant communities via comparison to in situ field monitoring. We found that honey bees can accurately indicate the onset of anthesis, but not its duration, in the plant species they selectively forage on. Increasing the number of colonies used to monitor, and employing a multi-locus approach for metabarcoding of pollen, substantially increased the species detection power of our approach. Here, we demonstrate that metabarcoding of honey bee collected pollen can substantively streamline the establishment of long-term phenological monitoring programs to document the on-going consequences of global climate change and its impact on the temporal aspects of plant-pollinator relationships.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,168 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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