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Enregistrement W4401810002 · doi:10.1038/s41467-024-51310-z

Loss of symmetric cell division of apical neural progenitors drives DENND5A-related developmental and epileptic encephalopathy

2024· article· en· W4401810002 sur OpenAlexafffund
Emily Banks, Vincent Francis, Sheng‐Jia Lin, Fares Kharfallah, Vladimir Fonov, Maxime Lévesque, Chanshuai Han, Gopinath Kulasekaran, Marius Tuznik, Armin Bayati, Reem A. Alkhater, Fowzan S. Alkuraya, Loukas Argyriou, Meisam Babaei, Melanie Bahlo, Behnoosh Bakhshoodeh, Eileen Barr, Lauren Bartik, Mahmoud Bassiony, Miriam Bertrand, Dominique Braun, Rebecca Buchert, M Budetta, Maxime Cadieux‐Dion, Daniel G. Calame, Heidi Cope, Donna Cushing, Stéphanie Efthymiou, Marwa Abd Elmaksoud, Huda G. El Said, Tawfiq Froukh, Harinder Gill, Joseph G. Gleeson, Laura Gogoll, Elaine Goh, Vykuntaraju K. Gowda, Tobias B. Haack, Stefan Hauser, Trevor L. Hoffman, Jacob S. Hogue, A Hosokawa, Henry Houlden, Kevin Huang, Stephanie Huynh, Ehsan Ghayoor Karimiani, Silke Kaulfuß, G. Christoph Korenke, Amy Kritzer, Hane Lee, James R. Lupski, Elysa J. Marco, Kirsty McWalter, Arakel Minassian, Berge A. Minassian, David Murphy, Juanita Neira‐Fresneda, Hope Northrup, Denis M. Nyaga, Barbara Oehl‐Jaschkowitz, Matthew Osmond, Richard Person, Davut Pehli̇van, Cassidy Petree, Lynette G. Sadleir, Carol Saunders, Ludger Schoels, Vandana Shashi, Rebecca C. Spillmann, Varunvenkat M. Srinivasan, Paria Najarzadeh Torbati, Tülay Tos, Maha S. Zaki, Dihong Zhou, Christiane Zweier, Jean‐François Trempe, Thomas M. Durcan, Ziv Gan‐Or, Massimo Avoli, Cesar Alves, Gaurav K. Varshney, Reza Maroofian, David A. Rudko, Peter S. McPherson

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensUniversity of OttawaB.C. Women's Hospital & Health CentreTrillium Health CentreChildren's Hospital of Eastern OntarioMcGill UniversityHospital for Sick ChildrenMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesOffice of Strategic CoordinationNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNIH Office of the DirectorNational Human Genome Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchGenome AlbertaKing Salman Center for Disability ResearchCommon FundServierOntario Genomics InstituteGenome British ColumbiaGenome CanadaDeutscher Akademischer AustauschdienstNational Institutes of HealthU.S. Department of Health and Human ServicesOntario GenomicsOntario Research FoundationU.S. Department of Defense
Mots-clésNeurogenesisBiologyProgenitor cellNeural stem cellNeuroscienceCell divisionMitosisStem cellInduced pluripotent stem cellAsymmetric cell divisionPhenotypeCell biologyEmbryonic stem cellCellGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Developmental and epileptic encephalopathies (DEEs) feature altered brain development, developmental delay and seizures, with seizures exacerbating developmental delay. Here we identify a cohort with biallelic variants in DENND5A, encoding a membrane trafficking protein, and develop animal models with phenotypes like the human syndrome. We demonstrate that DENND5A interacts with Pals1/MUPP1, components of the Crumbs apical polarity complex required for symmetrical division of neural progenitor cells. Human induced pluripotent stem cells lacking DENND5A fail to undergo symmetric cell division with an inherent propensity to differentiate into neurons. These phenotypes result from misalignment of the mitotic spindle in apical neural progenitors. Cells lacking DENND5A orient away from the proliferative apical domain surrounding the ventricles, biasing daughter cells towards a more fate-committed state, ultimately shortening the period of neurogenesis. This study provides a mechanism for DENND5A-related DEE that may be generalizable to other developmental conditions and provides variant-specific clinical information for physicians and families. Developmental and epileptic encephalopathies are devastating neurological disorders. Here, the authors establish a cohort of patients with variants in the gene DENND5A and use human stem cells to discover a disease mechanism involving altered cell division.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,247 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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