Recent advances in proteomic analysis to study carotid artery plaques
Notice bibliographique
Résumé
Objective: We sought to identify differentially expressed proteins in serum, plasma, and plaque samples of patients with carotid atherosclerotic lesions. Methods: We performed a systematic review of the proteomic profile of serum, plasma, and plaque samples of patients with carotid artery disease. We included full-length peer-reviewed studies of adult humans and reported them using PRISMA guidelines. The quality of the design and content of the articles included in the review was assessed using the Newcastle-Ottawa scale. Results: We included six peer-reviewed articles reporting protein expression in serum, plasma, or plaque samples from patients with carotid atherosclerosis. Three were single-center cross-sectional studies, two were single-center case-control studies, and one was a single-center cohort study. Thirty-six proteins were found to be expressed differentially when comparing samples from healthy subjects and individuals with diseased carotid vessels and between patients with symptomatic and asymptomatic carotid artery atherosclerotic lesions. Some of these were shown to be related to inflammatory or anti-inflammatory pathways in atherogenesis. CD5L and S100A12 were both found to be upregulated in patients with unstable plaque, the former owing to its anti-inflammatory properties and the latter for its pro-oxidant effects in atherosclerosis. ACTB is involved in cellular structure and integrity and was found to be downregulated in patients with ruptured carotid plaques. Conclusions: Atherosclerotic carotid disease places the patient at increased risk of ischemic neurological events. Proteomics may help to understand their pathophysiological processes and can identify differential protein expression in blood samples from healthy subjects and patients with carotid artery plaques. This patient-centered approach will allow for the timely identification of individuals at higher risk of experiencing stroke.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,014 | 0,024 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,003 | 0,003 |
| Bibliométrie | 0,012 | 0,009 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,003 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».