SARS-CoV-2 infection results in a unique lung proteome long after virus resolution in the hamster
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Long COVID or post-acute sequelae of COVID-19 (PASC) remains an ongoing public health issue that causes impairment for those afflicted and diminishes their ability to contribute to society. To address the host response underpinning respiratory PASC, we used the Golden Syrian hamster model infected with ancestral SARS-CoV-2 and examined its lung proteome in a longitudinal experiment. We infected young 6-week old male and female hamsters with 10 5 TCID 50 of virus via the intranasal route and sampled the lung at 1, 3, 5, and 31 days post infection (dpi). We compared the infected lung proteome to that of uninfected sex-matched controls. We found almost no differences in protein levels at 1 dpi, with hundreds at 3 dpi, and thousands at 5 dpi. Many overlapping differential protein levels and pathways were seen in both sexes at 3 and 5 dpi including the Coagulation and Complement cascades. Notably, we found differences between the sexes at 31 dpi which included many targets with decreased levels of protein in the males. We also noted an increase in 7 proteins in both sexes at 31 dpi including proteins responsible for airway mucosal layer integrity such as Mucin 5B and Calcium-activated chloride channel regulator 1. Longitudinally, 38 proteins were changed in levels across more than one timepoint in the males but only three proteins were in the females, Secretoglobin family 1 A member 1, Poly [ADP-ribose] polymerase, and Apolipoprotein D. Overall, we show that there are changes to the lung proteome at 31 dpi, a time when no SARS-CoV-2 remains, and that there are sex differences in that proteome after infection with the ancestral strain. We conclude that biological sex should be examined as a variable when testing medical countermeasures for PASC in the Golden Syrian hamster due to host differences between the sexes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».