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Enregistrement W4401886740 · doi:10.21873/invivo.13679

Analysis of Expression Status and Relationship Between Senescence-related Genes and Pancreatic Function-related Genes in Human Islets of Langerhans from Donors of Various Ages

2024· article· en· W4401886740 sur OpenAlexafffund
Hajime Imamura, Tomohiko Adachi, Daisuke Miyamoto, Tatsuya Kin, Mampei Yamashita, Hajime Matsushima, Takanobu Hara, Akihiko Soyama, Susumu Eguchi

Notice bibliographique

RevueIn Vivo · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePancreatic function and diabetes
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesUniversity of AlbertaAlberta Health Services
Mots-clésGeneSenescenceIsletPancreatic isletsFunction (biology)Gene expressionBiologyPancreasExpression (computer science)Cell biologyEndocrinologyInternal medicineGeneticsDiabetes mellitusMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND/AIM: Although studies on senescence-related genes using human islets of Langerhans have been performed, the expression of senescence-related genes and their association with functional genes in islets remain insufficiently investigated. We aimed to determine whether and what types of senescent-related genes are expressed in islets and identify their correlations with pancreatic function-related genes by using islets isolated for transplantation from individuals of various ages. MATERIALS AND METHODS: Islets from deceased donors of both sexes and different ages were used for analysis. The expression status of senescence-related genes (glutaminase 1, interleukin 6, interleukin 8, cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, cyclin-dependent kinase inhibitor 1A, and senescence-associated beta-galactosidase) and pancreatic function-related genes (glucagon and insulin) was examined by reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction, and their relationships with age were investigated. RESULTS: We obtained isolated human islets from 18 deceased multiorgan donors. There was no correlation between donor age and expression of any of the senescence-related genes. Regarding correlations between donor age and pancreatic function-related genes, age was positively correlated only with INS (r=0.49, p=0.03). INS expression was not correlated with that of GLS1 (r=0.23, p=0.34), IL6 (r=-0.06, p=0.79), or IL8 (r=-0.1, p=0.12), but positively related with p16 (r=0.89, p<0.0001), p21 (r=0.51, p=0.02), and SA-β-gal (r=0.52, p=0.02). CONCLUSION: We showed the functional potential even of aged islets, which were originally thought to be functionally impaired. We were unable to identify any senescence-related genes expressed in islets from donors of different ages. Therefore, a new index is needed to evaluate not only actual chronological age but also organ- and cell-specific age.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,167
Score d'incertitude au seuil0,473

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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