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Enregistrement W4401891658 · doi:10.1021/acs.jpcb.4c03363

Asymmetric Dynamics Drive Catalytic Activation of the Hsp90 Chaperone

2024· article· en· W4401891658 sur OpenAlexafffund
Breanna Magnan, X. Chen, Suad Rashid, Alissa Minard, William Chau, Toshi Uyesugi, Ross A. Edwards, Rashmi Panigrahi, J. N. Mark Glover, Paul LaPointe, Leo Spyracopoulos

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHeat shock proteins research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChaperone (clinical)Hsp90ChemistryCell biologyBiophysicsComputational biologyBiologyBiochemistryHeat shock proteinMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Hsp90 chaperone is an ATPase enzyme composed of two copies of a three-domain subunit. Hsp90 stabilizes and activates a diverse array of regulatory proteins. Substrates are bound and released by the middle domain through a clamping cycle involving conformational transitions between a dynamic open state and a compact conformationally restricted closed state. Intriguingly, the overall ATPase activity of dimeric Hsp90 can be asymmetrically enhanced through a single subunit when Hsp90 is bound to a cochaperone or when Hsp90 is composed of one active and one catalytically defunct subunit as a heterodimer. To explore the mechanism of asymmetric Hsp90 activation, we designed a subunit bearing N-terminal ATPase mutations that demonstrate increased intra- and interdomain dynamics. Using intact Hsp90 and various N-terminal and middle domain constructs, we blended 19 F NMR spectroscopy, molecular dynamics (MD) simulations, and ATPase assays to show that within the context of heterodimeric Hsp90, the conformationally dynamic subunit stimulates the ATPase activity of the normal subunit. The contrasting dynamic properties of the subunits within heterodimeric Hsp90 provide a mechanistic framework to understand the molecular basis for asymmetric Hsp90 activation and its importance for the biological function of Hsp90.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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