Lineage-specific phylogenetic structure of boreal habitats suggests different assembly processes across phylogenetic and spatial scales
Notice bibliographique
Résumé
Understanding how plant communities are assembled is critical to explaining the functioning of ecosystems and the maintenance of biodiversity. The phylogenetic distance among species in a community (community phylogenetic structure) has been used to infer deterministic and stochastic assembly processes, albeit with criticisms. However, the effect of the phylogenetic scale (old versus young lineages) and spatial scale on measures of community phylogenetic structure are rarely tested especially in the boreal biome, yet essential to unravel different assembly processes that might operate across species in a community. We examined lineage-specific phylogenetic structure of six plant communities defined at the habitat scale, and the phylogenetic structure of communities defined at a plot level scale (1m2). We obtained vascular plant species lists for six habitats (arctic-alpine barren, bog, fen, kalmia barren, limestone barren, and serpentine barren) on the island of Newfoundland, Canada, and 73 permanent vegetation plots within three of the above habitats to estimate their mean pairwise phylogenetic distance standardized for sample size (SES-MPD). Contrary to the expectation under the stress-dominance hypothesis of phylogenetic clustering in challenging boreal environments, the majority of clades had random phylogenetic structure. However, we observed a pattern consistent across most habitats of a shift from phylogenetic clustering at the deepest nodes of the angiosperms to no phylogenetic structure at shallower nodes, suggesting that different assembly processes may be operating at different phylogenetic scales within a habitat. As expected, all vegetation plot communities at a fine spatial scale showed strong phylogenetic overdispersion likely explained by biotic interactions. Our lineage-specific approach to estimate SES-MPD proved useful to outline testable hypotheses on the evolution and role functional traits play in community structure and assembly of boreal habitats
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».