Bulk mRNA-seq data from wild-type and prostate cancer-developing mice reveal a reprogramming of the estrogen and androgen responses after carcinogenesis
Notice bibliographique
Résumé
Sex hormones are necessary for the development and functions of the normal prostate as well as for the initiation and progression of prostate tumors. Indeed, androgens and estrogens can activate their respective nuclear receptors to modulate the expression of multiple genes and pathways in prostate cells. Nevertheless, the androgen and estrogen responses in the normal prostate, and the transcriptomic changes occurring after carcinogenesis, remain poorly understood. Here, wildtype mice and transgenic mice that spontaneously develop prostate cancer (C57BL/6J PB-Cre4 +/− ; Pten fl/fl ) were castrated to ensure hormone deprivation. After three days, animals received injections of testosterone and/or estradiol. After one day, the prostates were harvested, and RNA was purified for sequencing. Sequencing data were then analyzed to study transcriptional modulations following hormonal exposures in normal and tumoral murine prostates. New analyses can be carried out with specific fold-change thresholds for gene expression, or with different pair-wise combinations between conditions (treatments and/or mouse models). Together, the data generated herein are a useful tool to study hormonal transcriptional responses in prostate and prostate cancer biology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».