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Enregistrement W4401959669 · doi:10.1038/s41467-024-51646-6

TOPORS E3 ligase mediates resistance to hypomethylating agent cytotoxicity in acute myeloid leukemia cells

2024· article· en· W4401959669 sur OpenAlexfundno aff
Peter Truong, Sylvie Shen, Swapna Joshi, Md Imtiazul Islam, Ling Zhong, Mark J. Raftery, Ali Afrasiabi, Hamid Alinejad-Rokny, Mary Nguyen, Xiaoheng Zou, Golam Sarower Bhuyan, Chowdhury H. Sarowar, Elaheh Sadat Ghodousi, Olivia Stonehouse, Sara Mohamed, Cara E. Toscan, Patrick Connerty, Purvi M. Kakadia, Stefan K. Bohlander, Katharine A. Michie, Jonas Larsson, Richard B. Lock, Carl R. Walkley, Julie A.I. Thoms, Christopher J. Jolly, John E. Pimanda

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCancer Council NSWNational Health and Medical Research CouncilMedical Research CouncilNational Imaging FacilityTranslational Cancer Research NetworkUniversity of TorontoAnthony Rothe Memorial TrustPeter MacCallum Cancer CentreUniversity of New South WalesCancer Institute NSWAnalytical Center for the Government of the Russian FederationFred Hutchinson Cancer Research CenterAustralian Cancer Research FoundationAustralian Government
Mots-clésMyeloid leukemiaCytotoxicityHypomethylating agentCancer researchLeukemiaMyeloidUbiquitin ligaseChemistryMedicineImmunologyDNA methylationBiochemistryGeneUbiquitinIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypomethylating agents (HMAs) are frontline therapies for Myelodysplastic Neoplasms (MDS) and Acute Myeloid Leukemia (AML). However, acquired resistance and treatment failure are commonplace. To address this, we perform a genome-wide CRISPR-Cas9 screen in a human MDS-derived cell line, MDS-L, and identify TOPORS as a loss-of-function target that synergizes with HMAs, reducing leukemic burden and improving survival in xenograft models. We demonstrate that depletion of TOPORS mediates sensitivity to HMAs by predisposing leukemic blasts to an impaired DNA damage response (DDR) accompanied by an accumulation of SUMOylated DNMT1 in HMA-treated TOPORS-depleted cells. The combination of HMAs with targeting of TOPORS does not impair healthy hematopoiesis. While inhibitors of TOPORS are unavailable, we show that inhibition of protein SUMOylation with TAK-981 partially phenocopies HMA-sensitivity and DDR impairment. Overall, our data suggest that the combination of HMAs with inhibition of SUMOylation or TOPORS is a rational treatment option for High-Risk MDS (HR-MDS) or AML. Hypomethylating agents (HMAs) are frontline therapy for Myelodysplasia, but their efficacy is limited. Here, the authors show that depleting the dual E3-ligase TOPORS synergizes with HMAs by enhancing DNA damage in leukemia cells, improving survival in mouse models without preventing healthy hematopoiesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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