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Enregistrement W4401976440 · doi:10.1093/biolinnean/blae066

Contrasting interspecific hybridization patterns in two goby groups radiating in divergent freshwater habitats

2024· article· en· W4401976440 sur OpenAlexfundno aff
Ryosuke Ito, Tappei Mishina, Yasuyuki Hashiguchi, Katsutoshi Watanabe

Notice bibliographique

RevueBiological Journal of the Linnean Society · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of ScienceJapan Fisheries Research and Education Agency
Mots-clésBiologyGobyInterspecific competitionHabitatEcologyInterspecific hybridizationZoologyEvolutionary biologyFisheryFish <Actinopterygii>HybridBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Hybridization and introgression between closely related species significantly affect their evolutionary and ecological processes. Understanding the ecological, environmental, and geographical conditions that promote their occurrence is imperative. It is hypothesized that species inhabiting geologically unstable habitats or with life-history constraints that prevent evasion from such environments are more prone to interspecific hybridization, due to limited development of prezygotic isolation. To test this hypothesis, we conducted a comparative analysis of genome-wide hybridization patterns in two freshwater goby groups of Gymnogobius: the castaneus- and urotaenia-groups. Utilizing the newly determined draft genome of G. isaza and single nucleotide variants identified by RNA sequencing, we first established the species phylogeny and then examined genetic signatures of interspecific hybridization in each group. The results revealed that all castaneus-group species, which primarily inhabit unstable habitats such as ponds, have undergone interspecific hybridization. Conversely, no species of the urotaenia-group showed clear evidence of hybridization over a period of more than 1 million years. These species inhabit an ancient lake (one species) or rivers (three amphidromous species), the latter possessing potential dispersal abilities in early life to evade geological disturbances. These ecology–geology relationships have remarkable implications for the intricate processes of adaptation and speciation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,242 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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