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Enregistrement W4401976963 · doi:10.3389/fgene.2024.1382957

Association between vitamin D receptor gene polymorphisms and susceptibility to tuberculosis: a systematic review and meta-analysis

2024· review· en· W4401976963 sur OpenAlexaboutno aff
Rongshan Tao, Shujuan Xiao, Lian‐Ping Wang, Chunjie Hu, Huiqin Suo, R Long, Hangyu Liu, Wei Luo, Feng Hong, Jingming Zhao, Qingjie Li

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Genetics · 2024
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueVitamin D Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesPeople's Government of Jilin ProvinceEducation Department of Jilin ProvinceHealth Commission of Guizhou Province
Mots-clésMeta-analysisGeneticsGeneBiologyGenetic associationCalcitriol receptorTuberculosisGenome-wide association studyMedicineSingle-nucleotide polymorphismBioinformaticsGenotypeInternal medicinePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective Tuberculosis (TB) is the leading cause of mortality worldwide. Previous studies have reported that TB susceptibility can be caused by vitamin D deficiency, which is affected by polymorphisms in the vitamin D receptor (VDR) gene. However, these results have been inconsistent. Therefore, we performed a meta-analysis to investigate the association between VDR polymorphisms and TB susceptibility. Methods We systematically searched for relevant literature in PubMed, Embase, and Medline databases through December 31st, 2022. Inclusion and exclusion criteria were made to ensure that HIV-negative population is the targeted subjects. The pooled odds ratio (OR) and 95% confidence interval (CI) were then used to assess the strength of the association, and the quality of the included articles was evaluated using the Newcastle–Ottawa Scale. Potential sources of heterogeneity were evaluated based on subgroup and meta-regression analyses. Results In our meta-analysis, we found that the FokI polymorphism in the VDR gene was associated with increased TB susceptibility in the allele and recessive genotype models (OR f vs. F = 1.235, 95%CI: 1.035–1.475; OR ff vs. Ff + FF = 1.317, 95%CI: 1.005–1.727. Further subgroup analysis based on ethnicity demonstrated the association with the risk of TB in all genotype models of the FokI polymorphism for Han population. Meta-regression analysis also indicated that ethnicity could be a potential source of heterogeneity in the FokI and BsmI polymorphisms in the VDR gene. However, publication year was another source of heterogeneity for the TaqI polymorphism. Conclusion In summary, the FokI polymorphism in the VDR gene was found to increase the risk of TB in the HIV-negative population, both overall and in Asian populations. The findings presented in this paper could provide clues for preventing TB from the perspective of vitamin D supplementation, which is a controversial topic in the field of medicine and health.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,010
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,024
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: Méta-analyse
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,055

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0100,024
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0210,041
Bibliométrie0,0080,010
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0030,002
Science ouverte0,0030,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,057
Tête enseignante GPT0,358
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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