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Enregistrement W4401990884 · doi:10.1038/s41598-024-71170-3

High throughput screening of airway constriction in mouse lung slices

2024· article· en· W4401990884 sur OpenAlexafffund
Magali Boucher, Cyndi Henry, Louis Gélinas, Rosalie Packwood, Andrés Rojas‐Ruiz, Liah Fereydoonzad, Percival J. Graham, Ynuk Bossé

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience of respiration and sleep
Établissements canadiensUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université Laval
Mots-clésAirwayConstrictionLungThroughputMedicineComputer scienceInternal medicineAnesthesiaTelecommunications

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The level of airway constriction in thin slices of lung tissue is highly variable. Owing to the labor-intensive nature of these experiments, determining the number of airways to be analyzed in order to allocate a reliable value of constriction in one mouse is challenging. Herein, a new automated device for physiology and image analysis was used to facilitate high throughput screening of airway constriction in lung slices. Airway constriction was first quantified in slices of lungs from male BALB/c mice with and without experimental asthma that were inflated with agarose through the trachea or trans-parenchymal injections. Random sampling simulations were then conducted to determine the number of airways required per mouse to quantify maximal constriction. The constriction of 45 ± 12 airways per mouse in 32 mice were analyzed. Mean maximal constriction was 37.4 ± 32.0%. The agarose inflating technique did not affect the methacholine response. However, the methacholine constriction was affected by experimental asthma (p = 0.003), shifting the methacholine concentration-response curve to the right, indicating a decreased sensitivity. Simulations then predicted that approximately 35, 16 and 29 airways per mouse are needed to quantify the maximal constriction mean, standard deviation and coefficient of variation, respectively; these numbers varying between mice and with experimental asthma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,258 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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