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Enregistrement W4401995297 · doi:10.1101/2024.08.23.609447

BCL2L13 Influences Autophagy and Ceramide Metabolism without Affecting Temozolomide Resistance in Glioblastoma

2024· preprint· en· W4401995297 sur OpenAlexaff
Courtney Clark, Amir Barzegar Behrooz, Simone C. da Silva Rosa, Kianoosh Naghibzadeh, Mehdi Eshraghi, Joadi Jacobs, Xiaohui Weng, Rui Vitorino, Sudharsana Rao Ande, Amir Ravandi, Sanjiv Dhingra, Stevan Pecic, Shahla Shojaei, Saeid Ghavami

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2024
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensCancerCare ManitobaHealth Sciences CentreSt. Boniface HospitalChildren's Hospital Research Institute of ManitobaUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCeramideAutophagyTemozolomideApoptosisViability assayGene knockdownCancer researchFlux (metallurgy)Cell biologyChemistryBiologyGlioblastomaBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Temozolomide (TMZ) resistance in glioblastoma (GBM) arises through metabolic rewiring that links mitochondrial function, autophagy balance, and sphingolipid metabolism. TMZ resistant (R) U251 cells exhibited suppressed apoptosis and complete blockade of autophagy flux, evidenced by LC3II and p62 accumulation and insensitivity to Bafilomycin A1. BCL2L13, strongly upregulated in R cells, emerged as a dual regulator of mitophagy and ceramide metabolism. BCL2L13 knockdown (KD) produced opposite effects in TMZ sensitive (NR) and resistant cells: in NR cells, KD elevated LC3II, reduced respiratory reserve, and triggered compensatory lipid synthesis; in R cells, KD decreased LC3II without restoring flux or TMZ sensitivity. Lipidomic profiling revealed that BCL2L13 loss reactivated CerS6 in NR cells, increasing C16:0 and mid-chain ceramides, while relieving CerS2 inhibition in R cells, elevating very long chain (C22 to C24) and glycosylated ceramides. These distinct sphingolipid signatures were confirmed by PLS-DA and KEGG enrichment, which highlighted steroid hormone, arachidonic, and linoleic acid metabolism in NR KD cells versus neuroactive ligand-receptor and signaling pathways in R KD cells. Together, these findings position BCL2L13 as a molecular integrator of mitochondrial respiration, autophagy flux, and CerS-dependent lipid remodeling, unveiling a context-specific metabolic mechanism that supports GBM cell survival under chemotherapeutic stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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