Incorporating New Datatypes to Enhance Species Delimitation: A Case Study in Rice Paddy Snakes (Homalopsidae: Hypsiscopus)
Notice bibliographique
Résumé
Homalopsids (Old World Mud Snakes) include 59 semiaquatic species in Asia and Australasia that display an array of morphological adaptations, behaviors, and microhabitat preferences. These attributes make homalopsids an ideal model system for broader questions in evolutionary biology, but the diversity of this understudied group of snakes is still being described. Recognized species diversity in rice paddy snakes (Hypsiscopus) has recently doubled after nearly 200 years of taxonomic stability. However, the evolutionary distinctiveness of some populations remains in question. In this study, we compare mainland Southeast Asian populations of Hypsiscopus east and west of the Red River Basin in Vietnam, a known biogeographic barrier in Asia, using an iterative approach with molecular phylogenetic reconstruction, machine-learning morphological quantitative statistics, and ecological niche modeling. Our analyses show that populations west of the Red River Basin represent an independent evolutionary lineage that is distinct in genetics, morphospace, and habitat suitability, and so warrants species recognition. The holotype of H. wettsteini, a species originally described in error from Costa Rica, grouped morphometrically with the population at the Red River Basin and eastward, and those west of the Red River Basin are referred to the recently described H. murphyi. The two species may have diversified due to a variety of geological and environmental factors, and their recognition exemplifies the importance of multifaceted approaches in taxonomy for downstream biogeographic studies on speciation scenarios.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,010 | 0,020 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».