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Enregistrement W4402025880 · doi:10.1002/ppp3.10551

A phylogenetic approach for identifying new sources of economically important fatty acids in plants and algae

2024· article· en· W4402025880 sur OpenAlexaff
Serena Sbrizzi, Nora Mitchell, Lesley G. Campbell, Michael T. Arts, Nicole D. Borsato, Stefanie M. Colombo

Notice bibliographique

RevuePlants People Planet · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueLipid metabolism and biosynthesis
Établissements canadiensDalhousie UniversityToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlgaeBiologyPhylogenetic treePolyunsaturated fatty acidFatty acidPhylogeneticsBotanyCladeGreen algaeBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Societal Impact Statement New sources of essential and other nutritionally and/or pharmacologically important fatty acids for human use can be discovered through bioprospecting. Demonstrating how fatty acids in plants and algae are distributed across a phylogeny is a critical first step in this process. Here, new sources of essential omega‐3 fatty acids that are critically important to human health were identified, such as green and Chromista algae, bryophytes and some angiosperm families. The identification of certain taxa that are high in critical fatty acids is important for developing new sources of these healthful compounds. Summary Essential fatty acids (EFA) including long‐chain omega‐3 and omega‐6 EFA are key nutrients that broadly support the health of individuals and the ecosystems they inhabit. Production of these EFA is critical to global nutritional security, and therefore, it is imperative to assess the distribution patterns of FA in plants to bioprospect new resources that do not threaten biodiversity. We used a meta‐analytic approach (phylogenetic signal analysis), which incorporated a wide variety of taxa to map FA profiles including both presence and abundance of specific FA and EFA onto a plant phylogeny including algae, bryophytes, pteridophytes, gymnosperms and angiosperms. Our phylogenetic signal analysis revealed that presence/absence of most FA of interest were randomly or ubiquitously distributed, while FA content was significantly clustered in specific clades for most key FA (including eicosapentaenoic acid (EPA), docosahexaenoic acid (DHA) and nervonic acid). Both green and Chromista algae displayed relatively high proportions of EPA and DHA, while green algae contained higher proportional amounts of stearidonic acid (SDA). Further, signal analysis revealed high proportional content of gamma‐linoleic acid (GLA) in bryophytes and some angiosperm families, suggesting potential sources for bioprospecting GLA. This analysis provides a crucial foundation for understanding the influence of phylogenetic relationships in the relative proportions of key FA in plants and algae across a diverse phylogeny. Furthermore, in demonstrating how fatty acids in plants and algae are distributed across a phylogeny, we provide a critical first step in bioprospecting for new sources of essential and other nutritionally‐ and/or pharmacologically important fatty acids for human use.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,151
Score d'incertitude au seuil0,587

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2024
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Résumé présentoui

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