Inflammatory reprogramming of the tumor microenvironment by infiltrating clonal hematopoiesis is associated with adverse outcomes in solid cancer
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Clonal hematopoiesis (CH) – the expansion of somatically-mutated hematopoietic cells in blood – is common in solid cancers. CH is associated with systemic inflammation that may lead to cancer, but its impact on tumor biology is underexplored. Here, we report the effects of CH on the tumor microenvironment (TME) using 1,550 treatment-naïve patient samples from the CPTAC cohort. CH was present in 18.3% of patients, with one-third of CH mutations also detectable in tumor-derived DNA from the same individual (CH-Tum), reflecting CH-mutant leukocyte infiltration. The presence of CH-Tum was associated with worse survival across cancers, particularly for glioblastoma. Transcriptomics and proteomics revealed that CH drives inflammation in the TME in a cancer- and CH driver-specific manner, and may improve immunotherapy responses. In glioblastoma, CH associated with pronounced macrophage infiltration, inflammation, and an aggressive, mesenchymal phenotype. Our findings demonstrate that CH shapes the TME, with potential applications as a biomarker in precision oncology.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».