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Enregistrement W4402030502 · doi:10.1007/s42729-024-01866-y

Optimizing pH for Soil Enzyme Assays Reveals Important Biochemical Functions in Low pH Soil

2024· article· en· W4402030502 sur OpenAlexafffund
Tandra D. Fraser, Sarah Duddigan, Anita Díaz, Iain D. Green, Mark Tibbett

Notice bibliographique

RevueJournal of soil science and plant nutrition · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoil Carbon and Nitrogen Dynamics
Établissements canadiensVeterans Affairs CanadaHealth PEIBio Food Tech (Canada)University of Prince Edward Island
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food CanadaEuropean Commission
Mots-clésSoil enzymeEnzymeChemistrySoil scienceEnvironmental chemistrySoil pHSoil testEnzyme assayBiochemistryEnvironmental scienceSoil water

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Soil enzyme assays are often used as indicators of potential biological functions. The objective of this study was to understand enzyme activity across a range of soil pH. Soils (0–15 cm) were collected from a heathland restoration project (established 1999) on the Isle of Purbeck, UK with treatments of elemental sulphur or ferrous sulphate compared to a control, acid grassland and heathland. Enzyme assays were conducted using fluorescent substrates for β-1,4-glucosidase, β-N-acetylglucosaminidase (NAG) and phosphatase with a range of buffer pH from 3.0 to 12.0. Differences in soil pH were still evident with the control (pH 5.3) and ferrous sulphate (pH 5.2) significantly higher than elemental sulphur (pH 4.5), acid grassland (pH 4.3) and heathland (pH 4.0). The optimum buffer pH for enzyme assays varied from pH 3-4.5 for β-glucosidase, pH 4–5 for NAG and pH 4–6 for phosphatase. Comparisons using a standard MUB pH resulted in different conclusions compared to optimum pH. For example, β-glucosidase activity at pH 5 for the control was significantly higher than elemental sulphur, acid grassland, and heathland. However, there were no differences when the pH optimums were considered. Comparisons of phosphatase activity at MUB pH 6.5 resulted in higher activity in the control plots compared to the heathland, despite the heathland soils showing the highest activity at optimum buffer pH. By examining the relationships between soil pH, enzyme activity, and assay conditions, this study highlights the importance of optimizing pH in enzyme assays when comparing diverse soil types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,230
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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