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Enregistrement W4402042938 · doi:10.1172/jci180983

Parkin activates innate immunity and promotes antitumor immune responses

2024· article· en· W4402042938 sur OpenAlexaff
Michela Perego, Minjeong Yeon, Ekta Agarwal, Andrew T. Milcarek, Irene Bertolini, Chiara Camisaschi, Jagadish C. Ghosh, Hsin‐Yao Tang, Nathalie Grandvaux, Marcus Ruscetti, Andrew V. Kossenkov, Sarah Preston‐Alp, Italo Tempera, Noam Auslander, Dario C. Altieri

Notice bibliographique

RevueJournal of Clinical Investigation · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensUniversité de MontréalCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesU.S. National Library of MedicineNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésParkinBiologyUbiquitin ligaseTumor microenvironmentInnate immune systemCell biologyCytotoxic T cellImmune systemCancer researchImmunologyUbiquitinMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The activation of innate immunity and associated interferon (IFN) signaling have been implicated in cancer, but the regulators are elusive and links to tumor suppression remain undetermined. Here, we found that Parkin, an E3 ubiquitin ligase altered in Parkinson's Disease, was epigenetically silenced in cancer and its reexpression by clinically approved demethylating therapy stimulated transcription of a potent IFN response in tumor cells. This pathway required Parkin E3 ubiquitin ligase activity, involved the subcellular trafficking and release of the alarmin High Mobility Group Box 1 (HMGB1) and was associated with inhibition of NF-κB gene expression. In turn, Parkin-expressing cells released an IFN secretome that upregulated effector and cytotoxic CD8+ T cell markers, lowered the expression of immune inhibitory receptors TIM3 and LAG3, and stimulated high content of the self renewal/stem cell factor, TCF1. PRKN-induced CD8+ T cells selectively accumulated in the microenvironment and inhibited transgenic and syngeneic tumor growth in vivo. Therefore, Parkin is an epigenetically regulated activator of innate immunity and dual mode tumor suppressor, inhibiting intrinsic tumor traits of metabolism and cell invasion, while simultaneously reinvigorating CD8 T cell functions in the microenvironment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,374
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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