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Enregistrement W4402045218 · doi:10.3233/jnd-230130

GNE Myopathy: Genotype – Phenotype Correlation and Disease Progression in an Indian Cohort

2024· article· en· W4402045218 sur OpenAlexafffund
Dipti Baskar, Nishanth Reddy, Veeramani Preethish‐Kumar, Kiran Polavarapu, Vikas Nishadham, Seena Vengalil, Saraswati Nashi, Sai Bhargava Sanka, Mainak Bardhan, Akshata Huddar, Gopikrishnan Unnikrishnan, Ganaraja Valakunja Harikrishna, Swetha Gunasekaran, Priya Treesa Thomas, Muddasu Keerthipriya, Manu Santhappan Girija, Gautham Arunachal, Ram Murthy Anjanappa, Ichizo Nishino, Oksana Pogoryelova, Hanns Lochmüller, Atchayaram Nalini

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuromuscular Diseases · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueInflammatory Myopathies and Dermatomyositis
Établissements canadiensOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research ChairsNewcastle UniversityMuscular Dystrophy Canada
Mots-clésMedicineMyopathyMuscle biopsyInternal medicineWeaknessWastingRetrospective cohort studyCohortPediatricsCompound heterozygosityPathologyBiopsySurgeryPhenotypeGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Introduction: GNE myopathy is a rare slowly progressive adult-onset distal myopathy with autosomal recessive inheritance. It has distinctive features of quadriceps sparing with preferential anterior tibial involvement. Most patients eventually become wheelchair bound by 10-20 years after onset. This study analyzes the phenotype-genotype characteristics and disease progression in a large cohort of GNEM patients from India. Materials and methods: Retrospective observational study on GNEM from a quaternary neurology referral hospital in southern India. Data was collected from clinical phenotyping, serum creatine kinase levels, muscle biopsy histopathology, genetic analysis and functional assessment scales - IBMFRS and MDFRS. Results: 157 patients were included with mean age at onset and diagnosis: 26.5±6.2 years and 32.8±7.8 years, respectively. M:F ratio was 25 : 13. Most common presenting symptom: foot drop (46.5%) and limb girdle weakness (19.1%). Wasting and weakness of small muscles of hand and finger flexors seen in 66.2% and as an initial symptoms in 5.2%. Though tibialis anterior involvement was most common (89.2%), early quadriceps weakness was noted in 3.2% and Beevor's sign in 59.2%. Rimmed vacuoles were present in 75% of patients with muscle biopsy. Most common variant was the Indian Founder variant identified in 129 patients (c.2179 G>A, p.Val727Met - 82.2%) and most common zygosity being compound heterozygous state (n = 115, 87.5%). Biallelic kinase domain variations predisposed to a more severe phenotype. Wheelchair bound state noted in 8.9% with a mean age and duration of 32.0±7.1 and 6.3±4.9 years respectively, earlier than previous studies on other ethnic groups. Conclusion: This is the largest GNEM cohort reported from South Asia. The p.Val727Met variant in compound heterozygous state is noted in majority (82.2%) of the cases. Observed relationships between genotype and clinical parameters shows that severity of the disease might be attributable to specific GNE genotype and thus could aid in predicting the disease progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,468

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,270
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2024
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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