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Enregistrement W4402047114 · doi:10.3390/epidemiologia5030039

Optimising Clinical Epidemiology in Disease Outbreaks: Analysis of ISARIC-WHO COVID-19 Case Report Form Utilisation

2024· article· en· W4402047114 sur OpenAlexfundno aff
Laura Merson, Sara Duque, Esteban García-Gallo, Trokon Omarley Yeabah, Jamie Rylance, Janet Dı́az, Antoine Flahault

Notice bibliographique

RevueEpidemiologia · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineComputer Science
ThématiqueMachine Learning in Healthcare
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthKementerian Kesihatan MalaysiaAll-India Institute of Medical SciencesUniversity of Cape TownPrince Charles Hospital FoundationNorges ForskningsrådMedical Research CouncilKementerian Pendidikan NasionalConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoJST-Mirai ProgramMinistero della SaluteWorld Health OrganizationWellcome TrustUniversity College DublinSunnybrook Research InstituteInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleEuropean Federation of Pharmaceutical Industries and AssociationsMedical Research Charities GroupNational Institute for Health and Care ResearchCanadian Institutes of Health ResearchWellcomeEuropean CommissionInstituto de Salud Carlos IIIBill and Melinda Gates Foundation
Mots-clésCRFSData collectionOutbreakMedicineData qualityPsychological interventionDemographicsEpidemiologyConsistency (knowledge bases)Quality managementClinical trialConditional random fieldComputer scienceStatisticsInternal medicineDemographyOperations managementPathologyNursingArtificial intelligenceMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Standardised forms for capturing clinical data promote consistency in data collection and analysis across research sites, enabling faster, higher-quality evidence generation. ISARIC and the World Health Organization have developed case report forms (CRFs) for the clinical characterisation of several infectious disease outbreaks. To improve the design and quality of future forms, we analysed the inclusion and completion rates of the 243 fields on the ISARIC-WHO COVID-19 CRF. Data from 42 diverse collaborations, covering 1886 hospitals and 950,064 patients, were analysed. A mean of 129.6 fields (53%) were included in the adapted CRFs implemented across the sites. Consistent patterns of field inclusion and completion aligned with globally recognised research priorities in outbreaks of novel infectious diseases. Outcome status was the most highly included (95.2%) and completed (89.8%) field, followed by admission demographics (79.1% and 91.6%), comorbidities (77.9% and 79.0%), signs and symptoms (68.9% and 78.4%), and vitals (70.3% and 69.1%). Mean field completion was higher in severe patients (70.2%) than in all patients (61.6%). The results reveal how clinical characterisation CRFs can be streamlined to reduce data collection time, including the modularisation of CRFs, to offer a choice of data volume collection and the separation of critical care interventions. This data-driven approach to designing CRFs enhances the efficiency of data collection to inform patient care and public health response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,122
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,335
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,878
Score d'incertitude au seuil0,644

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,1220,335
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0090,013
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0020,005
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,238
Tête enseignante GPT0,510
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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