MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4402047830 · doi:10.3897/mycokeys.108.127734

Colletotrichum species (Glomerellales, Glomerellaceae) causing walnut anthracnose in China

2024· article· en· W4402047830 sur OpenAlexaff
Lin Zhang, Li-Li Zhao, Liang Chen, Luhan Yu, Ying Zhang

Notice bibliographique

RevueMycoKeys · 2024
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésColletotrichumBiologyChinaColletotrichum gloeosporioidesBotanyHorticultureGeographyArchaeology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Colletotrichum species can function as plant pathogens, saprobes or endophytes on a wide variety of plant hosts and are considered amongst the ten most significant genera of plant pathogens globally. China contributes almost half the walnut production in the world. However, Colletotrichum species occurring on walnut remain largely unresolved in China. To explore the Colletotrichum species found on walnut in China, 470 walnut fruit or leaf samples with anthracnose were collected from 14 main walnut-producing regions across seven provinces. A total of 165 Colletotrichum strains were isolated from these samples. The Colletotrichum isolates were identified, based on morphological characteristics and sequence analyses of ACT , CHS-1 , GAPDH , ITS and TUB2 . Twelve species, including 11 known Colletotrichum species ( C. boninense , C. citrulli , C. fioriniae , C. fructicola , C. godetiae , C. juglandicola , C. karsti , C. mengyinense , C. pandanicola , C. peakense and C. siamense ) and a novel species ( C. chinensis sp. nov. ) were identified. The species distribution revealed regional prevalence as follows: C. mengyinense was the most dominant species in Gansu, C. mengyinense and C. siamense in Shandong, C. chinensis in Beijing, C. pandanicola in Shaanxi and C. godetiae in Yunnan. Colletotrichum siamense was the sole species isolated in Sichuan and Xinjiang Provinces. Koch’s postulates were fulfilled, demonstrating that all 12 species cause anthracnose on walnut. This is the first report of C. boninense , C. citrulli and C. karsti as pathogens of walnut anthracnose worldwide.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,126

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2024
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMycoKeysMême sujetPlant Pathogens and Fungal DiseasesTravaux en français237 207